Protein–RNA interactions for Protein: Q8K5B8

Hoxc12, Homeobox protein Hox-C12, mousemouse

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Length 280 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc12Q8K5B8 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hoxc12Q8K5B8 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hoxc12Q8K5B8 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hoxc12Q8K5B8 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Hoxc12Q8K5B8 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hoxc12Q8K5B8 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hoxc12Q8K5B8 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hoxc12Q8K5B8 Dclk2-202ENSMUST00000191752 8042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hoxc12Q8K5B8 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Hoxc12Q8K5B8 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Hoxc12Q8K5B8 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hoxc12Q8K5B8 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Hoxc12Q8K5B8 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Hoxc12Q8K5B8 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hoxc12Q8K5B8 Gm17980-201ENSMUST00000217977 2349 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Hoxc12Q8K5B8 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Hoxc12Q8K5B8 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Hoxc12Q8K5B8 Wipf2-201ENSMUST00000037480 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hoxc12Q8K5B8 Aoc2-201ENSMUST00000041095 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hoxc12Q8K5B8 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hoxc12Q8K5B8 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hoxc12Q8K5B8 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hoxc12Q8K5B8 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hoxc12Q8K5B8 Csf1r-202ENSMUST00000115268 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hoxc12Q8K5B8 Nphs1-201ENSMUST00000006825 4608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hoxc12Q8K5B8 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hoxc12Q8K5B8 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hoxc12Q8K5B8 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hoxc12Q8K5B8 Plin4-202ENSMUST00000190703 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hoxc12Q8K5B8 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hoxc12Q8K5B8 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hoxc12Q8K5B8 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hoxc12Q8K5B8 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Hoxc12Q8K5B8 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hoxc12Q8K5B8 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hoxc12Q8K5B8 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hoxc12Q8K5B8 Hspa5-201ENSMUST00000028222 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hoxc12Q8K5B8 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hoxc12Q8K5B8 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hoxc12Q8K5B8 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hoxc12Q8K5B8 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hoxc12Q8K5B8 Gm36908-201ENSMUST00000218080 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hoxc12Q8K5B8 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hoxc12Q8K5B8 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hoxc12Q8K5B8 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hoxc12Q8K5B8 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hoxc12Q8K5B8 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hoxc12Q8K5B8 Pla2g4a-201ENSMUST00000070200 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hoxc12Q8K5B8 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hoxc12Q8K5B8 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hoxc12Q8K5B8 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hoxc12Q8K5B8 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hoxc12Q8K5B8 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hoxc12Q8K5B8 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hoxc12Q8K5B8 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hoxc12Q8K5B8 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hoxc12Q8K5B8 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Hoxc12Q8K5B8 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Hoxc12Q8K5B8 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hoxc12Q8K5B8 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hoxc12Q8K5B8 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
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Hoxc12Q8K5B8 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
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Hoxc12Q8K5B8 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
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Hoxc12Q8K5B8 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hoxc12Q8K5B8 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hoxc12Q8K5B8 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hoxc12Q8K5B8 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Hoxc12Q8K5B8 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hoxc12Q8K5B8 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hoxc12Q8K5B8 Zfp608-201ENSMUST00000064763 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hoxc12Q8K5B8 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hoxc12Q8K5B8 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hoxc12Q8K5B8 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hoxc12Q8K5B8 Dgkh-202ENSMUST00000226342 15261 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hoxc12Q8K5B8 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hoxc12Q8K5B8 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hoxc12Q8K5B8 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hoxc12Q8K5B8 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hoxc12Q8K5B8 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hoxc12Q8K5B8 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hoxc12Q8K5B8 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hoxc12Q8K5B8 Cep250-204ENSMUST00000109619 7977 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hoxc12Q8K5B8 Cep250-201ENSMUST00000039994 7979 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hoxc12Q8K5B8 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hoxc12Q8K5B8 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hoxc12Q8K5B8 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hoxc12Q8K5B8 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Hoxc12Q8K5B8 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Hoxc12Q8K5B8 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Hoxc12Q8K5B8 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Hoxc12Q8K5B8 AC140462.2-201ENSMUST00000225718 2433 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Hoxc12Q8K5B8 Tubgcp6-201ENSMUST00000041656 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
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