Protein–RNA interactions for Protein: Q8K193

Cldn34c1, Claudin 34C1, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c1Q8K193 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Cldn34c1Q8K193 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Cldn34c1Q8K193 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Cldn34c1Q8K193 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Cldn34c1Q8K193 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Cldn34c1Q8K193 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Cldn34c1Q8K193 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Cldn34c1Q8K193 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Cldn34c1Q8K193 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Cldn34c1Q8K193 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Cldn34c1Q8K193 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Cldn34c1Q8K193 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Cldn34c1Q8K193 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Cldn34c1Q8K193 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Cldn34c1Q8K193 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Cldn34c1Q8K193 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Cldn34c1Q8K193 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Cldn34c1Q8K193 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Cldn34c1Q8K193 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Cldn34c1Q8K193 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Cldn34c1Q8K193 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Cldn34c1Q8K193 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Cldn34c1Q8K193 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Cldn34c1Q8K193 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Cldn34c1Q8K193 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Cldn34c1Q8K193 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Cldn34c1Q8K193 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Cldn34c1Q8K193 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Cldn34c1Q8K193 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Cldn34c1Q8K193 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Cldn34c1Q8K193 Nrap-204ENSMUST00000166203 5079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Cldn34c1Q8K193 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Cldn34c1Q8K193 Znrf3-203ENSMUST00000172492 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Cldn34c1Q8K193 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Cldn34c1Q8K193 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Cldn34c1Q8K193 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Cldn34c1Q8K193 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Cldn34c1Q8K193 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC9.65□□□□□ -0.87
Cldn34c1Q8K193 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Cldn34c1Q8K193 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Cldn34c1Q8K193 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Cldn34c1Q8K193 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Cldn34c1Q8K193 Brd3-201ENSMUST00000028282 5419 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.87
Cldn34c1Q8K193 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Cldn34c1Q8K193 Cep250-204ENSMUST00000109619 7977 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.87
Cldn34c1Q8K193 Cep250-201ENSMUST00000039994 7979 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.87
Cldn34c1Q8K193 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.87
Cldn34c1Q8K193 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cldn34c1Q8K193 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cldn34c1Q8K193 Tgoln1-201ENSMUST00000070524 5013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cldn34c1Q8K193 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cldn34c1Q8K193 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cldn34c1Q8K193 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cldn34c1Q8K193 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
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Cldn34c1Q8K193 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cldn34c1Q8K193 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
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Cldn34c1Q8K193 Myocd-203ENSMUST00000108695 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
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Cldn34c1Q8K193 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Cldn34c1Q8K193 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cldn34c1Q8K193 Ciita-201ENSMUST00000023147 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
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Cldn34c1Q8K193 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
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Cldn34c1Q8K193 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
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Cldn34c1Q8K193 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Cldn34c1Q8K193 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cldn34c1Q8K193 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
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Cldn34c1Q8K193 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cldn34c1Q8K193 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cldn34c1Q8K193 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cldn34c1Q8K193 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cldn34c1Q8K193 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cldn34c1Q8K193 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cldn34c1Q8K193 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cldn34c1Q8K193 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cldn34c1Q8K193 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Cldn34c1Q8K193 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cldn34c1Q8K193 Slc36a4-201ENSMUST00000061568 6539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cldn34c1Q8K193 Vcan-202ENSMUST00000109544 5702 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cldn34c1Q8K193 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cldn34c1Q8K193 Srgap3-202ENSMUST00000088373 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cldn34c1Q8K193 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cldn34c1Q8K193 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
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Cldn34c1Q8K193 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
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Cldn34c1Q8K193 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
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