Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHD8

Rab11fip3, Rab11 family-interacting protein 3, mousemouse

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Length 1,047 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip3Q8CHD8 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab11fip3Q8CHD8 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab11fip3Q8CHD8 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab11fip3Q8CHD8 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab11fip3Q8CHD8 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab11fip3Q8CHD8 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab11fip3Q8CHD8 Gm15566-201ENSMUST00000121130 590 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab11fip3Q8CHD8 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab11fip3Q8CHD8 Gm8737-201ENSMUST00000122208 642 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab11fip3Q8CHD8 C730034F03Rik-201ENSMUST00000168646 1280 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab11fip3Q8CHD8 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab11fip3Q8CHD8 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab11fip3Q8CHD8 Gm45770-201ENSMUST00000212105 616 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab11fip3Q8CHD8 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab11fip3Q8CHD8 Csrp2-203ENSMUST00000219502 544 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab11fip3Q8CHD8 Tas2r126-201ENSMUST00000059534 930 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab11fip3Q8CHD8 Hist1h1b-201ENSMUST00000080511 743 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab11fip3Q8CHD8 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab11fip3Q8CHD8 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab11fip3Q8CHD8 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab11fip3Q8CHD8 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab11fip3Q8CHD8 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab11fip3Q8CHD8 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab11fip3Q8CHD8 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab11fip3Q8CHD8 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab11fip3Q8CHD8 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab11fip3Q8CHD8 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab11fip3Q8CHD8 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab11fip3Q8CHD8 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab11fip3Q8CHD8 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab11fip3Q8CHD8 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rab11fip3Q8CHD8 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rab11fip3Q8CHD8 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rab11fip3Q8CHD8 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rab11fip3Q8CHD8 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rab11fip3Q8CHD8 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rab11fip3Q8CHD8 Tsc22d4-204ENSMUST00000110983 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rab11fip3Q8CHD8 Mup-ps26-201ENSMUST00000121751 202 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Rab11fip3Q8CHD8 Gm17231-203ENSMUST00000170133 637 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rab11fip3Q8CHD8 Colec11-203ENSMUST00000220836 887 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rab11fip3Q8CHD8 AC154849.4-201ENSMUST00000224868 365 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Rab11fip3Q8CHD8 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rab11fip3Q8CHD8 Fam151b-201ENSMUST00000040106 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rab11fip3Q8CHD8 Fam92b-201ENSMUST00000048786 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
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Rab11fip3Q8CHD8 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rab11fip3Q8CHD8 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rab11fip3Q8CHD8 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rab11fip3Q8CHD8 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rab11fip3Q8CHD8 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rab11fip3Q8CHD8 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rab11fip3Q8CHD8 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab11fip3Q8CHD8 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab11fip3Q8CHD8 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab11fip3Q8CHD8 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab11fip3Q8CHD8 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab11fip3Q8CHD8 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab11fip3Q8CHD8 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab11fip3Q8CHD8 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab11fip3Q8CHD8 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab11fip3Q8CHD8 Sparc-209ENSMUST00000216313 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab11fip3Q8CHD8 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab11fip3Q8CHD8 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab11fip3Q8CHD8 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab11fip3Q8CHD8 Taf6l-202ENSMUST00000010249 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab11fip3Q8CHD8 Cstad-201ENSMUST00000102853 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab11fip3Q8CHD8 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Rab11fip3Q8CHD8 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Rab11fip3Q8CHD8 Mir6546-201ENSMUST00000184460 62 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab11fip3Q8CHD8 Pdzd9-203ENSMUST00000208635 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab11fip3Q8CHD8 AC101677.2-201ENSMUST00000218733 741 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Rab11fip3Q8CHD8 Gm29787-201ENSMUST00000222129 849 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab11fip3Q8CHD8 Ngdn-201ENSMUST00000022815 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab11fip3Q8CHD8 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab11fip3Q8CHD8 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab11fip3Q8CHD8 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab11fip3Q8CHD8 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab11fip3Q8CHD8 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab11fip3Q8CHD8 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab11fip3Q8CHD8 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab11fip3Q8CHD8 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab11fip3Q8CHD8 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab11fip3Q8CHD8 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab11fip3Q8CHD8 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab11fip3Q8CHD8 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab11fip3Q8CHD8 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab11fip3Q8CHD8 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab11fip3Q8CHD8 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab11fip3Q8CHD8 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab11fip3Q8CHD8 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab11fip3Q8CHD8 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab11fip3Q8CHD8 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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