Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBG9

Rnf170, E3 ubiquitin-protein ligase RNF170, mousemouse

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Length 286 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf170Q8CBG9 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rnf170Q8CBG9 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rnf170Q8CBG9 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Rnf170Q8CBG9 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Rnf170Q8CBG9 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Rnf170Q8CBG9 Col6a4-201ENSMUST00000121963 7371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rnf170Q8CBG9 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rnf170Q8CBG9 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rnf170Q8CBG9 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rnf170Q8CBG9 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Rnf170Q8CBG9 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rnf170Q8CBG9 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rnf170Q8CBG9 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rnf170Q8CBG9 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rnf170Q8CBG9 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rnf170Q8CBG9 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rnf170Q8CBG9 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Rnf170Q8CBG9 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rnf170Q8CBG9 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rnf170Q8CBG9 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rnf170Q8CBG9 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rnf170Q8CBG9 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rnf170Q8CBG9 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rnf170Q8CBG9 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rnf170Q8CBG9 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rnf170Q8CBG9 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rnf170Q8CBG9 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rnf170Q8CBG9 Sel1l-201ENSMUST00000021347 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rnf170Q8CBG9 Gm42427-201ENSMUST00000200473 5292 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
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Rnf170Q8CBG9 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rnf170Q8CBG9 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rnf170Q8CBG9 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
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Rnf170Q8CBG9 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rnf170Q8CBG9 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rnf170Q8CBG9 Slc45a4-201ENSMUST00000054266 4664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
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Rnf170Q8CBG9 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rnf170Q8CBG9 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rnf170Q8CBG9 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
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Rnf170Q8CBG9 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rnf170Q8CBG9 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
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Rnf170Q8CBG9 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rnf170Q8CBG9 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
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Rnf170Q8CBG9 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rnf170Q8CBG9 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rnf170Q8CBG9 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rnf170Q8CBG9 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rnf170Q8CBG9 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rnf170Q8CBG9 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rnf170Q8CBG9 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
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Rnf170Q8CBG9 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
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Rnf170Q8CBG9 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
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Rnf170Q8CBG9 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
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