Protein–RNA interactions for Protein: Q8C3L1

Ssuh2, Protein SSUH2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssuh2Q8C3L1 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ssuh2Q8C3L1 Gm9877-201ENSMUST00000064271 2627 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Ssuh2Q8C3L1 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ssuh2Q8C3L1 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ssuh2Q8C3L1 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ssuh2Q8C3L1 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ssuh2Q8C3L1 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Ssuh2Q8C3L1 Gm43081-201ENSMUST00000199082 1380 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Ssuh2Q8C3L1 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Ssuh2Q8C3L1 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ssuh2Q8C3L1 Rps9-204ENSMUST00000108625 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ssuh2Q8C3L1 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ssuh2Q8C3L1 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Ssuh2Q8C3L1 Gm14603-201ENSMUST00000121275 448 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Ssuh2Q8C3L1 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ssuh2Q8C3L1 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ssuh2Q8C3L1 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ssuh2Q8C3L1 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ssuh2Q8C3L1 Gm16172-201ENSMUST00000156224 682 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ssuh2Q8C3L1 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Ssuh2Q8C3L1 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ssuh2Q8C3L1 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ssuh2Q8C3L1 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ssuh2Q8C3L1 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Ssuh2Q8C3L1 Gm35189-201ENSMUST00000219319 789 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ssuh2Q8C3L1 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ssuh2Q8C3L1 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ssuh2Q8C3L1 Olfr1106-201ENSMUST00000099867 939 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ssuh2Q8C3L1 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ssuh2Q8C3L1 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ssuh2Q8C3L1 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ssuh2Q8C3L1 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ssuh2Q8C3L1 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Ssuh2Q8C3L1 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ssuh2Q8C3L1 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ssuh2Q8C3L1 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ssuh2Q8C3L1 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ssuh2Q8C3L1 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ssuh2Q8C3L1 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Ssuh2Q8C3L1 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ssuh2Q8C3L1 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ssuh2Q8C3L1 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ssuh2Q8C3L1 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ssuh2Q8C3L1 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ssuh2Q8C3L1 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ssuh2Q8C3L1 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ssuh2Q8C3L1 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Ssuh2Q8C3L1 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ssuh2Q8C3L1 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ssuh2Q8C3L1 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ssuh2Q8C3L1 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ssuh2Q8C3L1 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ssuh2Q8C3L1 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ssuh2Q8C3L1 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ssuh2Q8C3L1 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ssuh2Q8C3L1 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ssuh2Q8C3L1 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Ssuh2Q8C3L1 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ssuh2Q8C3L1 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Ssuh2Q8C3L1 Bud31-206ENSMUST00000162308 705 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ssuh2Q8C3L1 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ssuh2Q8C3L1 A330048O09Rik-201ENSMUST00000180777 672 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ssuh2Q8C3L1 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Ssuh2Q8C3L1 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ssuh2Q8C3L1 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ssuh2Q8C3L1 Gm8285-201ENSMUST00000208293 759 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Ssuh2Q8C3L1 Gm45072-201ENSMUST00000208673 929 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Ssuh2Q8C3L1 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ssuh2Q8C3L1 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Ssuh2Q8C3L1 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ssuh2Q8C3L1 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ssuh2Q8C3L1 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ssuh2Q8C3L1 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ssuh2Q8C3L1 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ssuh2Q8C3L1 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ssuh2Q8C3L1 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ssuh2Q8C3L1 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ssuh2Q8C3L1 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ssuh2Q8C3L1 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ssuh2Q8C3L1 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ssuh2Q8C3L1 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ssuh2Q8C3L1 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ssuh2Q8C3L1 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ssuh2Q8C3L1 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ssuh2Q8C3L1 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ssuh2Q8C3L1 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ssuh2Q8C3L1 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ssuh2Q8C3L1 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ssuh2Q8C3L1 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ssuh2Q8C3L1 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ssuh2Q8C3L1 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ssuh2Q8C3L1 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ssuh2Q8C3L1 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ssuh2Q8C3L1 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ssuh2Q8C3L1 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ssuh2Q8C3L1 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ssuh2Q8C3L1 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ssuh2Q8C3L1 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Ssuh2Q8C3L1 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ssuh2Q8C3L1 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.3 ms