Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGA3

Lrrtm2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, mousemouse

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Length 515 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm2Q8BGA3 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Lrrtm2Q8BGA3 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Lrrtm2Q8BGA3 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Lrrtm2Q8BGA3 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Lrrtm2Q8BGA3 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Lrrtm2Q8BGA3 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Lrrtm2Q8BGA3 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Lrrtm2Q8BGA3 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Lrrtm2Q8BGA3 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Lrrtm2Q8BGA3 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Lrrtm2Q8BGA3 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Lrrtm2Q8BGA3 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Lrrtm2Q8BGA3 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Lrrtm2Q8BGA3 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Lrrtm2Q8BGA3 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Lrrtm2Q8BGA3 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Lrrtm2Q8BGA3 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Lrrtm2Q8BGA3 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Lrrtm2Q8BGA3 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Lrrtm2Q8BGA3 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Lrrtm2Q8BGA3 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Lrrtm2Q8BGA3 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Lrrtm2Q8BGA3 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Lrrtm2Q8BGA3 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Lrrtm2Q8BGA3 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Lrrtm2Q8BGA3 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Lrrtm2Q8BGA3 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Lrrtm2Q8BGA3 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Lrrtm2Q8BGA3 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Lrrtm2Q8BGA3 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Lrrtm2Q8BGA3 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Lrrtm2Q8BGA3 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Lrrtm2Q8BGA3 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Lrrtm2Q8BGA3 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Lrrtm2Q8BGA3 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Lrrtm2Q8BGA3 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Lrrtm2Q8BGA3 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Lrrtm2Q8BGA3 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Lrrtm2Q8BGA3 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Lrrtm2Q8BGA3 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Lrrtm2Q8BGA3 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Lrrtm2Q8BGA3 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Lrrtm2Q8BGA3 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Lrrtm2Q8BGA3 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Lrrtm2Q8BGA3 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Lrrtm2Q8BGA3 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Lrrtm2Q8BGA3 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Lrrtm2Q8BGA3 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Lrrtm2Q8BGA3 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Lrrtm2Q8BGA3 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Lrrtm2Q8BGA3 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Lrrtm2Q8BGA3 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Lrrtm2Q8BGA3 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Lrrtm2Q8BGA3 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Lrrtm2Q8BGA3 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Lrrtm2Q8BGA3 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Lrrtm2Q8BGA3 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Lrrtm2Q8BGA3 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Lrrtm2Q8BGA3 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Lrrtm2Q8BGA3 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Lrrtm2Q8BGA3 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Lrrtm2Q8BGA3 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Lrrtm2Q8BGA3 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Lrrtm2Q8BGA3 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Lrrtm2Q8BGA3 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Lrrtm2Q8BGA3 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Lrrtm2Q8BGA3 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Lrrtm2Q8BGA3 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Lrrtm2Q8BGA3 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Lrrtm2Q8BGA3 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Lrrtm2Q8BGA3 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Lrrtm2Q8BGA3 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Lrrtm2Q8BGA3 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Lrrtm2Q8BGA3 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Lrrtm2Q8BGA3 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Lrrtm2Q8BGA3 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Lrrtm2Q8BGA3 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Lrrtm2Q8BGA3 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Lrrtm2Q8BGA3 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Lrrtm2Q8BGA3 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Lrrtm2Q8BGA3 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Lrrtm2Q8BGA3 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Lrrtm2Q8BGA3 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Lrrtm2Q8BGA3 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Lrrtm2Q8BGA3 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Lrrtm2Q8BGA3 Gm45418-202ENSMUST00000210693 649 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Lrrtm2Q8BGA3 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Lrrtm2Q8BGA3 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Lrrtm2Q8BGA3 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Lrrtm2Q8BGA3 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Lrrtm2Q8BGA3 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Lrrtm2Q8BGA3 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Lrrtm2Q8BGA3 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Lrrtm2Q8BGA3 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Lrrtm2Q8BGA3 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Lrrtm2Q8BGA3 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Lrrtm2Q8BGA3 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Lrrtm2Q8BGA3 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Lrrtm2Q8BGA3 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Lrrtm2Q8BGA3 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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