Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMX5

Shq1, Protein SHQ1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 569 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shq1Q7TMX5 Gm45570-201ENSMUST00000211137 495 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
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Shq1Q7TMX5 Cdpf1-205ENSMUST00000150995 566 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
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Shq1Q7TMX5 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
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Shq1Q7TMX5 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
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Shq1Q7TMX5 Rpl4-201ENSMUST00000034966 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Shq1Q7TMX5 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Shq1Q7TMX5 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
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Shq1Q7TMX5 Hils1-201ENSMUST00000038928 864 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Shq1Q7TMX5 Chmp3-202ENSMUST00000065364 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
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Shq1Q7TMX5 Gm10334-201ENSMUST00000095999 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Shq1Q7TMX5 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Shq1Q7TMX5 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Shq1Q7TMX5 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Shq1Q7TMX5 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Shq1Q7TMX5 Gm21358-201ENSMUST00000191645 1659 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Shq1Q7TMX5 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Shq1Q7TMX5 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms