Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQF0

Topbp1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Topbp1Q6ZQF0 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Topbp1Q6ZQF0 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Topbp1Q6ZQF0 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Topbp1Q6ZQF0 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Topbp1Q6ZQF0 Serpinb9c-202ENSMUST00000110284 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Topbp1Q6ZQF0 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Topbp1Q6ZQF0 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Topbp1Q6ZQF0 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Topbp1Q6ZQF0 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Topbp1Q6ZQF0 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Topbp1Q6ZQF0 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Topbp1Q6ZQF0 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Topbp1Q6ZQF0 C1qtnf3-201ENSMUST00000022853 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Topbp1Q6ZQF0 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Topbp1Q6ZQF0 Trav11-201ENSMUST00000103585 343 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Topbp1Q6ZQF0 Trav11d-201ENSMUST00000103648 342 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Topbp1Q6ZQF0 Gm12705-201ENSMUST00000129460 872 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Topbp1Q6ZQF0 Ubl5-211ENSMUST00000162303 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Topbp1Q6ZQF0 4930578M01Rik-201ENSMUST00000180490 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Topbp1Q6ZQF0 Gm20781-201ENSMUST00000193154 693 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Topbp1Q6ZQF0 Gm21736-201ENSMUST00000195399 693 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Topbp1Q6ZQF0 Gm37197-201ENSMUST00000195607 401 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Topbp1Q6ZQF0 Trav11n-201ENSMUST00000200113 343 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Topbp1Q6ZQF0 Gm44008-201ENSMUST00000204345 412 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Topbp1Q6ZQF0 Nt5dc1-206ENSMUST00000213269 802 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Topbp1Q6ZQF0 Gm8255-201ENSMUST00000218693 305 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Topbp1Q6ZQF0 n-R5s71-201ENSMUST00000093668 119 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Topbp1Q6ZQF0 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Topbp1Q6ZQF0 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Topbp1Q6ZQF0 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Topbp1Q6ZQF0 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Topbp1Q6ZQF0 Triml2-201ENSMUST00000163869 1467 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Topbp1Q6ZQF0 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Topbp1Q6ZQF0 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Topbp1Q6ZQF0 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Topbp1Q6ZQF0 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Topbp1Q6ZQF0 Samhd1-203ENSMUST00000109549 3245 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Topbp1Q6ZQF0 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Topbp1Q6ZQF0 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Topbp1Q6ZQF0 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Topbp1Q6ZQF0 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Topbp1Q6ZQF0 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Topbp1Q6ZQF0 Gm33831-201ENSMUST00000211696 1542 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Topbp1Q6ZQF0 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Topbp1Q6ZQF0 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Topbp1Q6ZQF0 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Topbp1Q6ZQF0 Igtp-203ENSMUST00000168280 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Topbp1Q6ZQF0 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Topbp1Q6ZQF0 Gm6158-201ENSMUST00000109467 904 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Topbp1Q6ZQF0 Ube2d-ps-201ENSMUST00000121354 441 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Topbp1Q6ZQF0 Gm13783-201ENSMUST00000131634 732 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Topbp1Q6ZQF0 Mrto4-ps2-201ENSMUST00000164169 549 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Topbp1Q6ZQF0 Gm37452-201ENSMUST00000194416 1160 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Topbp1Q6ZQF0 Klk1b15-ps-201ENSMUST00000206273 715 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Topbp1Q6ZQF0 4933402C05Rik-201ENSMUST00000208189 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Topbp1Q6ZQF0 Gm6331-201ENSMUST00000217890 450 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Topbp1Q6ZQF0 Gm9102-201ENSMUST00000219250 465 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Topbp1Q6ZQF0 Gm5178-201ENSMUST00000219380 898 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Topbp1Q6ZQF0 4921508M14Rik-201ENSMUST00000061679 1099 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Topbp1Q6ZQF0 Acot13-201ENSMUST00000006900 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Topbp1Q6ZQF0 Krtap12-1-201ENSMUST00000092370 656 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Topbp1Q6ZQF0 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Topbp1Q6ZQF0 Gm6170-201ENSMUST00000187672 1388 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Topbp1Q6ZQF0 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Topbp1Q6ZQF0 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Topbp1Q6ZQF0 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Topbp1Q6ZQF0 Prf1-201ENSMUST00000035419 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Topbp1Q6ZQF0 Ckap2-201ENSMUST00000046916 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Topbp1Q6ZQF0 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Topbp1Q6ZQF0 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Topbp1Q6ZQF0 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Topbp1Q6ZQF0 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Topbp1Q6ZQF0 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Topbp1Q6ZQF0 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Topbp1Q6ZQF0 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Topbp1Q6ZQF0 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Topbp1Q6ZQF0 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Topbp1Q6ZQF0 Il1f5-205ENSMUST00000147885 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Topbp1Q6ZQF0 Gm9915-201ENSMUST00000066196 1383 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Topbp1Q6ZQF0 Gcg-201ENSMUST00000102733 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Topbp1Q6ZQF0 Gm3409-202ENSMUST00000110599 1154 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Topbp1Q6ZQF0 Gm11475-201ENSMUST00000118482 476 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Topbp1Q6ZQF0 Gm13707-201ENSMUST00000123663 600 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Topbp1Q6ZQF0 1700057H21Rik-202ENSMUST00000154530 506 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Topbp1Q6ZQF0 Gm3415-202ENSMUST00000179214 1154 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Topbp1Q6ZQF0 Gm19013-201ENSMUST00000183895 1222 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Topbp1Q6ZQF0 Gm19014-201ENSMUST00000184828 1189 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Topbp1Q6ZQF0 2410002F23Rik-220ENSMUST00000191537 872 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Topbp1Q6ZQF0 Gm3409-203ENSMUST00000199142 1167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Topbp1Q6ZQF0 Gm3402-203ENSMUST00000200228 1154 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Topbp1Q6ZQF0 Gm31520-203ENSMUST00000204874 647 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Topbp1Q6ZQF0 Gm40761-201ENSMUST00000219123 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Topbp1Q6ZQF0 Lsm8-201ENSMUST00000056398 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Topbp1Q6ZQF0 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Topbp1Q6ZQF0 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Topbp1Q6ZQF0 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Topbp1Q6ZQF0 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Topbp1Q6ZQF0 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Topbp1Q6ZQF0 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Topbp1Q6ZQF0 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.4 ms