Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZS0

Pdzrn3, E3 ubiquitin-protein ligase PDZRN3, mousemouse

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Length 1,063 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzrn3Q69ZS0 Ccdc153-202ENSMUST00000213891 792 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pdzrn3Q69ZS0 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Pdzrn3Q69ZS0 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pdzrn3Q69ZS0 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pdzrn3Q69ZS0 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Pdzrn3Q69ZS0 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pdzrn3Q69ZS0 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pdzrn3Q69ZS0 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pdzrn3Q69ZS0 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pdzrn3Q69ZS0 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Pdzrn3Q69ZS0 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pdzrn3Q69ZS0 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Pdzrn3Q69ZS0 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Pdzrn3Q69ZS0 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pdzrn3Q69ZS0 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Pdzrn3Q69ZS0 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Pdzrn3Q69ZS0 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pdzrn3Q69ZS0 AC122408.1-201ENSMUST00000218949 218 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Pdzrn3Q69ZS0 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Pdzrn3Q69ZS0 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pdzrn3Q69ZS0 Art3-202ENSMUST00000117108 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pdzrn3Q69ZS0 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pdzrn3Q69ZS0 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pdzrn3Q69ZS0 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pdzrn3Q69ZS0 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pdzrn3Q69ZS0 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pdzrn3Q69ZS0 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pdzrn3Q69ZS0 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pdzrn3Q69ZS0 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Pdzrn3Q69ZS0 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Pdzrn3Q69ZS0 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.06
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