Protein–RNA interactions for Protein: Q64347

Clcn1, Chloride channel protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 994 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clcn1Q64347 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clcn1Q64347 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clcn1Q64347 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clcn1Q64347 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clcn1Q64347 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clcn1Q64347 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clcn1Q64347 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clcn1Q64347 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clcn1Q64347 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clcn1Q64347 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clcn1Q64347 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clcn1Q64347 Ormdl2-201ENSMUST00000026409 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clcn1Q64347 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clcn1Q64347 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clcn1Q64347 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clcn1Q64347 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clcn1Q64347 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clcn1Q64347 Rps9-203ENSMUST00000108624 478 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clcn1Q64347 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Clcn1Q64347 Gm12899-201ENSMUST00000120565 551 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Clcn1Q64347 Gm12798-201ENSMUST00000124786 666 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clcn1Q64347 Gm13257-201ENSMUST00000132840 665 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clcn1Q64347 Tsc22d1-206ENSMUST00000134109 801 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clcn1Q64347 B230119M05Rik-201ENSMUST00000154072 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clcn1Q64347 8030442B05Rik-201ENSMUST00000192626 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clcn1Q64347 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clcn1Q64347 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Clcn1Q64347 5830428M24Rik-204ENSMUST00000223143 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clcn1Q64347 Cmtm2a-201ENSMUST00000034344 1081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clcn1Q64347 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clcn1Q64347 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clcn1Q64347 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clcn1Q64347 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clcn1Q64347 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clcn1Q64347 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clcn1Q64347 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clcn1Q64347 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clcn1Q64347 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clcn1Q64347 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clcn1Q64347 Psmc2-201ENSMUST00000030769 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clcn1Q64347 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clcn1Q64347 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clcn1Q64347 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clcn1Q64347 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clcn1Q64347 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clcn1Q64347 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clcn1Q64347 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clcn1Q64347 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clcn1Q64347 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clcn1Q64347 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clcn1Q64347 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clcn1Q64347 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clcn1Q64347 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clcn1Q64347 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clcn1Q64347 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clcn1Q64347 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clcn1Q64347 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clcn1Q64347 Gm14399-202ENSMUST00000108929 813 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clcn1Q64347 Olfr22-ps1-201ENSMUST00000115991 1237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clcn1Q64347 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clcn1Q64347 Gm14585-201ENSMUST00000120713 634 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Clcn1Q64347 AA387200-201ENSMUST00000147463 1177 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clcn1Q64347 Ighv1-48-201ENSMUST00000191795 294 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Clcn1Q64347 Gm36943-201ENSMUST00000194422 282 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Clcn1Q64347 Gm37905-201ENSMUST00000195310 341 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Clcn1Q64347 Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clcn1Q64347 Gm35822-201ENSMUST00000204954 562 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clcn1Q64347 Gm45550-201ENSMUST00000209380 946 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Clcn1Q64347 AC153505.1-201ENSMUST00000218819 1071 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Clcn1Q64347 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clcn1Q64347 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clcn1Q64347 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Clcn1Q64347 Cd59a-201ENSMUST00000040423 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clcn1Q64347 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clcn1Q64347 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clcn1Q64347 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Clcn1Q64347 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Clcn1Q64347 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Clcn1Q64347 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Clcn1Q64347 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Clcn1Q64347 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Clcn1Q64347 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Clcn1Q64347 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Clcn1Q64347 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Clcn1Q64347 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Clcn1Q64347 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Clcn1Q64347 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Clcn1Q64347 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Clcn1Q64347 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Clcn1Q64347 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Clcn1Q64347 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Clcn1Q64347 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Clcn1Q64347 Gm11706-201ENSMUST00000151282 316 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Clcn1Q64347 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Clcn1Q64347 Coa3-202ENSMUST00000168089 291 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Clcn1Q64347 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Clcn1Q64347 Smlr1-201ENSMUST00000179685 669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Clcn1Q64347 Ptbp2-210ENSMUST00000198403 389 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Clcn1Q64347 Gm17831-201ENSMUST00000205579 900 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Clcn1Q64347 Gm34821-201ENSMUST00000208399 1031 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.5 ms