Protein–RNA interactions for Protein: Q62318

Trim28, Transcription intermediary factor 1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 834 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim28Q62318 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim28Q62318 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim28Q62318 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim28Q62318 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim28Q62318 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Trim28Q62318 Gm22138-201ENSMUST00000158748 128 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim28Q62318 Mir7076-201ENSMUST00000183519 74 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim28Q62318 Gm27910-201ENSMUST00000185004 107 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim28Q62318 Vmn1r205-201ENSMUST00000185475 951 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Trim28Q62318 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim28Q62318 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Trim28Q62318 AC118639.2-201ENSMUST00000226289 223 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
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Trim28Q62318 Lst1-201ENSMUST00000097336 415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Trim28Q62318 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim28Q62318 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim28Q62318 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim28Q62318 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim28Q62318 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Trim28Q62318 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Trim28Q62318 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim28Q62318 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim28Q62318 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim28Q62318 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Trim28Q62318 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Trim28Q62318 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Trim28Q62318 Apoo-202ENSMUST00000113896 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Trim28Q62318 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim28Q62318 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim28Q62318 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim28Q62318 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim28Q62318 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim28Q62318 Rps9-204ENSMUST00000108625 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim28Q62318 Clps-202ENSMUST00000114785 369 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim28Q62318 Gm12899-201ENSMUST00000120565 551 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim28Q62318 Gm10320-201ENSMUST00000170205 527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Trim28Q62318 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim28Q62318 Odf3-201ENSMUST00000026555 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim28Q62318 Gm4978-201ENSMUST00000071565 801 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim28Q62318 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim28Q62318 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim28Q62318 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim28Q62318 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.5 ms