Protein–RNA interactions for Protein: Q60673

Ptprn, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, mousemouse

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Length 979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprnQ60673 1700023C21Rik-201ENSMUST00000143247 389 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
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PtprnQ60673 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
PtprnQ60673 Gm44421-201ENSMUST00000205064 1221 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
PtprnQ60673 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
PtprnQ60673 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
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PtprnQ60673 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
PtprnQ60673 Acrbp-201ENSMUST00000032481 584 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
PtprnQ60673 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
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PtprnQ60673 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
PtprnQ60673 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
PtprnQ60673 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
PtprnQ60673 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
PtprnQ60673 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
PtprnQ60673 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
PtprnQ60673 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
PtprnQ60673 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
PtprnQ60673 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
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PtprnQ60673 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
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PtprnQ60673 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
PtprnQ60673 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
PtprnQ60673 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
PtprnQ60673 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
PtprnQ60673 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
PtprnQ60673 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
PtprnQ60673 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
PtprnQ60673 Eloc-201ENSMUST00000115352 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
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PtprnQ60673 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
PtprnQ60673 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
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PtprnQ60673 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
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PtprnQ60673 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
PtprnQ60673 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
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PtprnQ60673 Gm44840-201ENSMUST00000208983 1168 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
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PtprnQ60673 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
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PtprnQ60673 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
PtprnQ60673 Il17c-201ENSMUST00000050963 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
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PtprnQ60673 Gm45449-201ENSMUST00000211485 1960 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
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PtprnQ60673 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
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PtprnQ60673 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
PtprnQ60673 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.47
PtprnQ60673 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
PtprnQ60673 Olfr114-203ENSMUST00000216249 1457 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
PtprnQ60673 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PtprnQ60673 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PtprnQ60673 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PtprnQ60673 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PtprnQ60673 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PtprnQ60673 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
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PtprnQ60673 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PtprnQ60673 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
PtprnQ60673 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PtprnQ60673 Gm37785-201ENSMUST00000195783 2408 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
PtprnQ60673 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
PtprnQ60673 Defb30-202ENSMUST00000111207 989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PtprnQ60673 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
PtprnQ60673 Gm25843-201ENSMUST00000122582 314 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
PtprnQ60673 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
PtprnQ60673 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
PtprnQ60673 Gm9211-201ENSMUST00000182882 975 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
PtprnQ60673 Gm38139-201ENSMUST00000195806 704 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
PtprnQ60673 Gm43830-201ENSMUST00000198760 1067 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
PtprnQ60673 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms