Protein–RNA interactions for Protein: Q5RIS0

Gm11487, Novel protein, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm11487Q5RIS0 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm11487Q5RIS0 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm11487Q5RIS0 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm11487Q5RIS0 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm11487Q5RIS0 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm11487Q5RIS0 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm11487Q5RIS0 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm11487Q5RIS0 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm11487Q5RIS0 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm11487Q5RIS0 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm11487Q5RIS0 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm11487Q5RIS0 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm11487Q5RIS0 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm11487Q5RIS0 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm11487Q5RIS0 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm11487Q5RIS0 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm11487Q5RIS0 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm11487Q5RIS0 Gm16166-201ENSMUST00000118291 787 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm11487Q5RIS0 Gm11244-201ENSMUST00000121243 237 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm11487Q5RIS0 Igf1-205ENSMUST00000121952 798 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm11487Q5RIS0 Treml4-202ENSMUST00000125426 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm11487Q5RIS0 Gad1-207ENSMUST00000148210 1021 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm11487Q5RIS0 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm11487Q5RIS0 Apoe-210ENSMUST00000174710 514 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm11487Q5RIS0 Gm6771-201ENSMUST00000182716 1001 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm11487Q5RIS0 Gm28836-201ENSMUST00000185842 633 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm11487Q5RIS0 2610027F03Rik-202ENSMUST00000186982 603 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm11487Q5RIS0 Gm28722-201ENSMUST00000187630 1036 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm11487Q5RIS0 Gm8531-201ENSMUST00000188319 893 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm11487Q5RIS0 Gm44315-201ENSMUST00000203041 219 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm11487Q5RIS0 Gm8574-201ENSMUST00000203207 924 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm11487Q5RIS0 Gm40578-201ENSMUST00000220837 390 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm11487Q5RIS0 Gm46336-201ENSMUST00000221894 279 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm11487Q5RIS0 AC136986.1-201ENSMUST00000222829 380 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm11487Q5RIS0 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm11487Q5RIS0 Commd4-201ENSMUST00000065358 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm11487Q5RIS0 Gm9962-201ENSMUST00000085241 321 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm11487Q5RIS0 n-R5s211-201ENSMUST00000093689 119 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm11487Q5RIS0 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm11487Q5RIS0 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm11487Q5RIS0 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm11487Q5RIS0 Psmc2-201ENSMUST00000030769 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm11487Q5RIS0 Gm7278-201ENSMUST00000119836 1401 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm11487Q5RIS0 Slc10a1-203ENSMUST00000218342 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm11487Q5RIS0 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm11487Q5RIS0 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm11487Q5RIS0 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm11487Q5RIS0 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm11487Q5RIS0 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm11487Q5RIS0 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm11487Q5RIS0 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm11487Q5RIS0 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm11487Q5RIS0 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm11487Q5RIS0 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm11487Q5RIS0 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm11487Q5RIS0 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm11487Q5RIS0 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm11487Q5RIS0 Clic3-201ENSMUST00000102918 791 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm11487Q5RIS0 Gm14892-201ENSMUST00000117636 267 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm11487Q5RIS0 Gm21972-201ENSMUST00000135197 776 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm11487Q5RIS0 Gzmc-201ENSMUST00000015585 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm11487Q5RIS0 Elof1-202ENSMUST00000166335 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm11487Q5RIS0 Csmd2os-202ENSMUST00000179945 643 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm11487Q5RIS0 Mir8093-201ENSMUST00000185043 137 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm11487Q5RIS0 Gm5100-201ENSMUST00000195631 589 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm11487Q5RIS0 Cdipt-202ENSMUST00000205830 805 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm11487Q5RIS0 5830428M24Rik-201ENSMUST00000221805 825 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm11487Q5RIS0 CT009546.1-201ENSMUST00000222573 1120 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm11487Q5RIS0 Uba52-201ENSMUST00000081940 541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm11487Q5RIS0 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm11487Q5RIS0 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm11487Q5RIS0 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm11487Q5RIS0 Gm42651-201ENSMUST00000199851 1339 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm11487Q5RIS0 AC166836.1-201ENSMUST00000219933 1795 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm11487Q5RIS0 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm11487Q5RIS0 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm11487Q5RIS0 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm11487Q5RIS0 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm11487Q5RIS0 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm11487Q5RIS0 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm11487Q5RIS0 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm11487Q5RIS0 Uba6-202ENSMUST00000113373 3504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm11487Q5RIS0 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm11487Q5RIS0 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm11487Q5RIS0 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm11487Q5RIS0 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Gm11487Q5RIS0 Gm4593-201ENSMUST00000205334 1555 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Gm11487Q5RIS0 Ccndbp1-203ENSMUST00000099489 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Gm11487Q5RIS0 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Gm11487Q5RIS0 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Gm11487Q5RIS0 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Gm11487Q5RIS0 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Gm11487Q5RIS0 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Gm11487Q5RIS0 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Gm11487Q5RIS0 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Gm11487Q5RIS0 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm11487Q5RIS0 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm11487Q5RIS0 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm11487Q5RIS0 Gm2000-201ENSMUST00000102782 445 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm11487Q5RIS0 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.5 ms