Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT3

Fam208b, Protein FAM208B, mousemouse

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Length 2,382 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam208bQ5DTT3 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Fam208bQ5DTT3 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Fam208bQ5DTT3 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Fam208bQ5DTT3 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Fam208bQ5DTT3 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Fam208bQ5DTT3 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Fam208bQ5DTT3 Rad51c-201ENSMUST00000007790 1632 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Fam208bQ5DTT3 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Fam208bQ5DTT3 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Fam208bQ5DTT3 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Fam208bQ5DTT3 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Fam208bQ5DTT3 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Fam208bQ5DTT3 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Fam208bQ5DTT3 Zc3h12a-201ENSMUST00000036188 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Fam208bQ5DTT3 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Fam208bQ5DTT3 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Fam208bQ5DTT3 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Fam208bQ5DTT3 Prr33-202ENSMUST00000151580 399 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Fam208bQ5DTT3 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Fam208bQ5DTT3 Gm3017-201ENSMUST00000203603 1126 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Fam208bQ5DTT3 AC112945.1-201ENSMUST00000226413 514 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Fam208bQ5DTT3 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Fam208bQ5DTT3 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Fam208bQ5DTT3 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Fam208bQ5DTT3 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Fam208bQ5DTT3 Gm18198-201ENSMUST00000204986 1551 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Fam208bQ5DTT3 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Fam208bQ5DTT3 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Fam208bQ5DTT3 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Fam208bQ5DTT3 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Fam208bQ5DTT3 Hspa14-201ENSMUST00000027961 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Fam208bQ5DTT3 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Fam208bQ5DTT3 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Fam208bQ5DTT3 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Fam208bQ5DTT3 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Fam208bQ5DTT3 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Fam208bQ5DTT3 Bmp4-202ENSMUST00000100676 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Fam208bQ5DTT3 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Fam208bQ5DTT3 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Fam208bQ5DTT3 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Fam208bQ5DTT3 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Fam208bQ5DTT3 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Fam208bQ5DTT3 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Fam208bQ5DTT3 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Fam208bQ5DTT3 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Fam208bQ5DTT3 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Fam208bQ5DTT3 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Fam208bQ5DTT3 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Fam208bQ5DTT3 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Fam208bQ5DTT3 Gm25766-201ENSMUST00000104101 131 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Fam208bQ5DTT3 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Fam208bQ5DTT3 Smim5-202ENSMUST00000142089 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Fam208bQ5DTT3 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Fam208bQ5DTT3 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Fam208bQ5DTT3 E030018B13Rik-201ENSMUST00000177638 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Fam208bQ5DTT3 Gm26989-201ENSMUST00000182608 749 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Fam208bQ5DTT3 Gm4654-201ENSMUST00000183305 982 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Fam208bQ5DTT3 Cdipt-202ENSMUST00000205830 805 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Fam208bQ5DTT3 Gm45338-206ENSMUST00000211460 1155 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Fam208bQ5DTT3 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Fam208bQ5DTT3 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Fam208bQ5DTT3 Gm6685-201ENSMUST00000042595 764 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Fam208bQ5DTT3 Gm16380-201ENSMUST00000077997 478 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Fam208bQ5DTT3 n-R5s211-201ENSMUST00000093689 119 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Fam208bQ5DTT3 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Fam208bQ5DTT3 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Fam208bQ5DTT3 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Fam208bQ5DTT3 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Fam208bQ5DTT3 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Fam208bQ5DTT3 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Fam208bQ5DTT3 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Fam208bQ5DTT3 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Fam208bQ5DTT3 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Fam208bQ5DTT3 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Fam208bQ5DTT3 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Fam208bQ5DTT3 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Fam208bQ5DTT3 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Fam208bQ5DTT3 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Fam208bQ5DTT3 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Fam208bQ5DTT3 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Fam208bQ5DTT3 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Fam208bQ5DTT3 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Fam208bQ5DTT3 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Fam208bQ5DTT3 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Fam208bQ5DTT3 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Fam208bQ5DTT3 Lyplal1-201ENSMUST00000045388 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Fam208bQ5DTT3 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Fam208bQ5DTT3 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Fam208bQ5DTT3 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Fam208bQ5DTT3 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Fam208bQ5DTT3 Gm15036-201ENSMUST00000118880 400 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Fam208bQ5DTT3 Gm12856-201ENSMUST00000119471 1293 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Fam208bQ5DTT3 BB557941-201ENSMUST00000126549 1097 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Fam208bQ5DTT3 Gm13267-201ENSMUST00000142787 698 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Fam208bQ5DTT3 Mfsd11-212ENSMUST00000153084 1194 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Fam208bQ5DTT3 Nlrp5-ps-202ENSMUST00000173220 1294 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Fam208bQ5DTT3 Iqcf3-202ENSMUST00000186668 633 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Fam208bQ5DTT3 2310074N15Rik-201ENSMUST00000198276 582 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Fam208bQ5DTT3 Gm43610-201ENSMUST00000199117 365 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Fam208bQ5DTT3 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
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