Protein–RNA interactions for Protein: Q3V118

Ccdc185, Coiled-coil domain-containing 185, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc185Q3V118 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ccdc185Q3V118 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ccdc185Q3V118 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ccdc185Q3V118 Gm22334-201ENSMUST00000158070 133 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Ccdc185Q3V118 Mir1943-201ENSMUST00000158276 73 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Ccdc185Q3V118 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ccdc185Q3V118 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ccdc185Q3V118 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ccdc185Q3V118 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ccdc185Q3V118 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Ccdc185Q3V118 Gm37246-201ENSMUST00000192665 835 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Ccdc185Q3V118 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ccdc185Q3V118 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Ccdc185Q3V118 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ccdc185Q3V118 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ccdc185Q3V118 Gm45118-201ENSMUST00000208928 825 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Ccdc185Q3V118 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ccdc185Q3V118 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Ccdc185Q3V118 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Ccdc185Q3V118 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ccdc185Q3V118 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ccdc185Q3V118 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ccdc185Q3V118 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ccdc185Q3V118 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ccdc185Q3V118 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ccdc185Q3V118 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ccdc185Q3V118 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ccdc185Q3V118 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ccdc185Q3V118 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Ccdc185Q3V118 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ccdc185Q3V118 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ccdc185Q3V118 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ccdc185Q3V118 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ccdc185Q3V118 Ghsr-201ENSMUST00000057186 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ccdc185Q3V118 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ccdc185Q3V118 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccdc185Q3V118 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccdc185Q3V118 Mecom-202ENSMUST00000108270 5692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccdc185Q3V118 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccdc185Q3V118 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccdc185Q3V118 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccdc185Q3V118 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccdc185Q3V118 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccdc185Q3V118 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccdc185Q3V118 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccdc185Q3V118 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccdc185Q3V118 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccdc185Q3V118 Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccdc185Q3V118 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccdc185Q3V118 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccdc185Q3V118 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccdc185Q3V118 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccdc185Q3V118 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccdc185Q3V118 Gm12616-201ENSMUST00000118594 382 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccdc185Q3V118 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccdc185Q3V118 n-R5s14-201ENSMUST00000122688 107 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccdc185Q3V118 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccdc185Q3V118 Gm12624-201ENSMUST00000177615 382 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccdc185Q3V118 Gm12621-201ENSMUST00000177760 382 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccdc185Q3V118 Gm12615-201ENSMUST00000177970 382 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccdc185Q3V118 Gm12622-201ENSMUST00000177975 382 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccdc185Q3V118 Gm8546-201ENSMUST00000178288 1264 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccdc185Q3V118 Gm12627-201ENSMUST00000178412 382 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccdc185Q3V118 Gm12625-201ENSMUST00000179122 382 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccdc185Q3V118 Gm12614-201ENSMUST00000179586 382 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccdc185Q3V118 Gm12613-201ENSMUST00000180323 382 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccdc185Q3V118 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccdc185Q3V118 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccdc185Q3V118 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccdc185Q3V118 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccdc185Q3V118 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccdc185Q3V118 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccdc185Q3V118 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccdc185Q3V118 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccdc185Q3V118 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccdc185Q3V118 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccdc185Q3V118 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccdc185Q3V118 Ntrk2-201ENSMUST00000079828 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccdc185Q3V118 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccdc185Q3V118 Ank3-205ENSMUST00000092433 5072 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccdc185Q3V118 Cacna1c-205ENSMUST00000112825 7577 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccdc185Q3V118 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccdc185Q3V118 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccdc185Q3V118 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccdc185Q3V118 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccdc185Q3V118 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccdc185Q3V118 Gm17518-201ENSMUST00000181232 1346 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccdc185Q3V118 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccdc185Q3V118 Armcx4-201ENSMUST00000124226 7996 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccdc185Q3V118 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccdc185Q3V118 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccdc185Q3V118 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccdc185Q3V118 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccdc185Q3V118 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccdc185Q3V118 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccdc185Q3V118 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccdc185Q3V118 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccdc185Q3V118 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccdc185Q3V118 Bms1-201ENSMUST00000032237 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccdc185Q3V118 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms