Protein–RNA interactions for Protein: Q3U4B1

Ssbp4, Single stranded DNA binding protein 4, isoform CRA_b, mousemouse

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Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssbp4Q3U4B1 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ssbp4Q3U4B1 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ssbp4Q3U4B1 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ssbp4Q3U4B1 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ssbp4Q3U4B1 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ssbp4Q3U4B1 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ssbp4Q3U4B1 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ssbp4Q3U4B1 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ssbp4Q3U4B1 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ssbp4Q3U4B1 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ssbp4Q3U4B1 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ssbp4Q3U4B1 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ssbp4Q3U4B1 Znrf3-203ENSMUST00000172492 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ssbp4Q3U4B1 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ssbp4Q3U4B1 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ssbp4Q3U4B1 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ssbp4Q3U4B1 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ssbp4Q3U4B1 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ssbp4Q3U4B1 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ssbp4Q3U4B1 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ssbp4Q3U4B1 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ssbp4Q3U4B1 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ssbp4Q3U4B1 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ssbp4Q3U4B1 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ssbp4Q3U4B1 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ssbp4Q3U4B1 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ssbp4Q3U4B1 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ssbp4Q3U4B1 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ssbp4Q3U4B1 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ssbp4Q3U4B1 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ssbp4Q3U4B1 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ssbp4Q3U4B1 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Ssbp4Q3U4B1 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ssbp4Q3U4B1 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ssbp4Q3U4B1 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ssbp4Q3U4B1 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Ssbp4Q3U4B1 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Ssbp4Q3U4B1 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ssbp4Q3U4B1 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ssbp4Q3U4B1 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ssbp4Q3U4B1 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ssbp4Q3U4B1 Gm12165-201ENSMUST00000117047 342 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Ssbp4Q3U4B1 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Ssbp4Q3U4B1 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Ssbp4Q3U4B1 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ssbp4Q3U4B1 Gm13408-201ENSMUST00000119822 798 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Ssbp4Q3U4B1 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Ssbp4Q3U4B1 Gm13935-201ENSMUST00000121859 798 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Ssbp4Q3U4B1 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Ssbp4Q3U4B1 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ssbp4Q3U4B1 4930562C15Rik-202ENSMUST00000171105 1299 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ssbp4Q3U4B1 Crnde-207ENSMUST00000180102 732 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ssbp4Q3U4B1 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ssbp4Q3U4B1 Gm9211-201ENSMUST00000182882 975 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Ssbp4Q3U4B1 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ssbp4Q3U4B1 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ssbp4Q3U4B1 Rbakdn-201ENSMUST00000198334 520 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ssbp4Q3U4B1 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ssbp4Q3U4B1 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Ssbp4Q3U4B1 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Ssbp4Q3U4B1 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ssbp4Q3U4B1 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Ssbp4Q3U4B1 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ssbp4Q3U4B1 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ssbp4Q3U4B1 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ssbp4Q3U4B1 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Ssbp4Q3U4B1 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ssbp4Q3U4B1 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ssbp4Q3U4B1 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ssbp4Q3U4B1 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ssbp4Q3U4B1 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ssbp4Q3U4B1 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ssbp4Q3U4B1 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ssbp4Q3U4B1 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ssbp4Q3U4B1 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ssbp4Q3U4B1 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ssbp4Q3U4B1 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ssbp4Q3U4B1 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ssbp4Q3U4B1 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ssbp4Q3U4B1 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ssbp4Q3U4B1 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ssbp4Q3U4B1 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ssbp4Q3U4B1 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ssbp4Q3U4B1 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ssbp4Q3U4B1 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ssbp4Q3U4B1 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Ssbp4Q3U4B1 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ssbp4Q3U4B1 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ssbp4Q3U4B1 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ssbp4Q3U4B1 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ssbp4Q3U4B1 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ssbp4Q3U4B1 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ssbp4Q3U4B1 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ssbp4Q3U4B1 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ssbp4Q3U4B1 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ssbp4Q3U4B1 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ssbp4Q3U4B1 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Ssbp4Q3U4B1 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ssbp4Q3U4B1 Gm16172-201ENSMUST00000156224 682 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ssbp4Q3U4B1 Gm9550-201ENSMUST00000161130 862 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms