Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF55

Atp2b3, Calcium-transporting ATPase, mousemouse

Predictions only

Length 1,220 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2b3Q0VF55 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atp2b3Q0VF55 Spcs1-203ENSMUST00000226374 592 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Atp2b3Q0VF55 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Atp2b3Q0VF55 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atp2b3Q0VF55 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atp2b3Q0VF55 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atp2b3Q0VF55 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atp2b3Q0VF55 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atp2b3Q0VF55 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atp2b3Q0VF55 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atp2b3Q0VF55 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atp2b3Q0VF55 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atp2b3Q0VF55 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atp2b3Q0VF55 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Atp2b3Q0VF55 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atp2b3Q0VF55 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atp2b3Q0VF55 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atp2b3Q0VF55 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atp2b3Q0VF55 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atp2b3Q0VF55 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atp2b3Q0VF55 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atp2b3Q0VF55 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atp2b3Q0VF55 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atp2b3Q0VF55 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atp2b3Q0VF55 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Atp2b3Q0VF55 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Atp2b3Q0VF55 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atp2b3Q0VF55 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atp2b3Q0VF55 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atp2b3Q0VF55 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atp2b3Q0VF55 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atp2b3Q0VF55 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Atp2b3Q0VF55 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Atp2b3Q0VF55 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atp2b3Q0VF55 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atp2b3Q0VF55 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atp2b3Q0VF55 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atp2b3Q0VF55 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atp2b3Q0VF55 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atp2b3Q0VF55 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atp2b3Q0VF55 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atp2b3Q0VF55 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atp2b3Q0VF55 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atp2b3Q0VF55 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atp2b3Q0VF55 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atp2b3Q0VF55 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atp2b3Q0VF55 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atp2b3Q0VF55 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atp2b3Q0VF55 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atp2b3Q0VF55 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atp2b3Q0VF55 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Atp2b3Q0VF55 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atp2b3Q0VF55 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atp2b3Q0VF55 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atp2b3Q0VF55 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atp2b3Q0VF55 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atp2b3Q0VF55 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atp2b3Q0VF55 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Atp2b3Q0VF55 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Atp2b3Q0VF55 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atp2b3Q0VF55 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Atp2b3Q0VF55 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atp2b3Q0VF55 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atp2b3Q0VF55 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atp2b3Q0VF55 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atp2b3Q0VF55 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atp2b3Q0VF55 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atp2b3Q0VF55 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atp2b3Q0VF55 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atp2b3Q0VF55 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atp2b3Q0VF55 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atp2b3Q0VF55 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atp2b3Q0VF55 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Atp2b3Q0VF55 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atp2b3Q0VF55 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atp2b3Q0VF55 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atp2b3Q0VF55 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atp2b3Q0VF55 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atp2b3Q0VF55 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atp2b3Q0VF55 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atp2b3Q0VF55 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atp2b3Q0VF55 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atp2b3Q0VF55 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atp2b3Q0VF55 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atp2b3Q0VF55 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atp2b3Q0VF55 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atp2b3Q0VF55 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atp2b3Q0VF55 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atp2b3Q0VF55 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Atp2b3Q0VF55 Gm9062-201ENSMUST00000117712 727 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Atp2b3Q0VF55 Gm6335-201ENSMUST00000118081 1194 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
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