Protein–RNA interactions for Protein: Q08423

Tff1, Trefoil factor 1, mousemouse

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Length 87 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tff1Q08423 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Tff1Q08423 Zfp710-202ENSMUST00000164056 5871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Tff1Q08423 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Tff1Q08423 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Tff1Q08423 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Tff1Q08423 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Tff1Q08423 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Tff1Q08423 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
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Tff1Q08423 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Tff1Q08423 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Tff1Q08423 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Tff1Q08423 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Tff1Q08423 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Tff1Q08423 Plin4-201ENSMUST00000002908 5755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Tff1Q08423 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
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Tff1Q08423 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
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Tff1Q08423 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
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Tff1Q08423 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Tff1Q08423 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Tff1Q08423 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Tff1Q08423 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Tff1Q08423 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Tff1Q08423 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
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Tff1Q08423 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Tff1Q08423 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
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Tff1Q08423 Zfp629-202ENSMUST00000084564 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
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Tff1Q08423 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
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Tff1Q08423 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Tff1Q08423 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
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Tff1Q08423 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
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Tff1Q08423 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Tff1Q08423 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
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Tff1Q08423 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
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Tff1Q08423 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Tff1Q08423 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Tff1Q08423 Erbin-201ENSMUST00000022222 6369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Tff1Q08423 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Tff1Q08423 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Tff1Q08423 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
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Tff1Q08423 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Tff1Q08423 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Tff1Q08423 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Tff1Q08423 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Tff1Q08423 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Tff1Q08423 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Tff1Q08423 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
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