Protein–RNA interactions for Protein: Q08093

Cnn2, Calponin-2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnn2Q08093 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cnn2Q08093 Ntrk2-201ENSMUST00000079828 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cnn2Q08093 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cnn2Q08093 Bahcc1-201ENSMUST00000044985 10726 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cnn2Q08093 Ltbp2-201ENSMUST00000002073 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cnn2Q08093 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cnn2Q08093 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Cnn2Q08093 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cnn2Q08093 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cnn2Q08093 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cnn2Q08093 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cnn2Q08093 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cnn2Q08093 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cnn2Q08093 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cnn2Q08093 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cnn2Q08093 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cnn2Q08093 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cnn2Q08093 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cnn2Q08093 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cnn2Q08093 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Cnn2Q08093 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cnn2Q08093 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cnn2Q08093 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cnn2Q08093 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cnn2Q08093 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cnn2Q08093 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cnn2Q08093 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cnn2Q08093 Myh6-201ENSMUST00000081857 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cnn2Q08093 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cnn2Q08093 Col6a6-202ENSMUST00000098441 8781 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cnn2Q08093 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cnn2Q08093 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Cnn2Q08093 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cnn2Q08093 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cnn2Q08093 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cnn2Q08093 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cnn2Q08093 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Cnn2Q08093 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cnn2Q08093 Tmod2-201ENSMUST00000064433 9884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cnn2Q08093 Nlrp6-203ENSMUST00000183845 4436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cnn2Q08093 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cnn2Q08093 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cnn2Q08093 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cnn2Q08093 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Cnn2Q08093 Tcp11l1-202ENSMUST00000111118 5474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cnn2Q08093 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cnn2Q08093 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cnn2Q08093 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cnn2Q08093 Cad-204ENSMUST00000201182 6529 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cnn2Q08093 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cnn2Q08093 Cbl-211ENSMUST00000206720 11372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cnn2Q08093 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cnn2Q08093 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cnn2Q08093 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Cnn2Q08093 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cnn2Q08093 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cnn2Q08093 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cnn2Q08093 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cnn2Q08093 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cnn2Q08093 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Cnn2Q08093 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cnn2Q08093 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cnn2Q08093 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cnn2Q08093 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cnn2Q08093 Socs6-201ENSMUST00000070116 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cnn2Q08093 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cnn2Q08093 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cnn2Q08093 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cnn2Q08093 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cnn2Q08093 Dixdc1-203ENSMUST00000117646 5719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cnn2Q08093 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cnn2Q08093 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Cnn2Q08093 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cnn2Q08093 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cnn2Q08093 Grip1-205ENSMUST00000105262 4996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cnn2Q08093 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cnn2Q08093 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cnn2Q08093 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cnn2Q08093 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cnn2Q08093 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cnn2Q08093 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cnn2Q08093 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cnn2Q08093 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cnn2Q08093 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cnn2Q08093 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cnn2Q08093 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cnn2Q08093 Cacna1s-204ENSMUST00000160641 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cnn2Q08093 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Cnn2Q08093 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cnn2Q08093 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cnn2Q08093 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cnn2Q08093 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Cnn2Q08093 Fam120b-201ENSMUST00000055352 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cnn2Q08093 Gabra1-201ENSMUST00000020707 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cnn2Q08093 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cnn2Q08093 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cnn2Q08093 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cnn2Q08093 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Cnn2Q08093 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cnn2Q08093 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms