Protein–RNA interactions for Protein: Q07646

Mest, Mesoderm-specific transcript protein, mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MestQ07646 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
MestQ07646 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
MestQ07646 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
MestQ07646 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
MestQ07646 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
MestQ07646 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
MestQ07646 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
MestQ07646 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
MestQ07646 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
MestQ07646 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
MestQ07646 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
MestQ07646 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
MestQ07646 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
MestQ07646 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
MestQ07646 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
MestQ07646 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
MestQ07646 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
MestQ07646 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
MestQ07646 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
MestQ07646 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
MestQ07646 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
MestQ07646 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
MestQ07646 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
MestQ07646 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
MestQ07646 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
MestQ07646 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
MestQ07646 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
MestQ07646 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
MestQ07646 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
MestQ07646 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
MestQ07646 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
MestQ07646 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
MestQ07646 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
MestQ07646 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
MestQ07646 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
MestQ07646 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
MestQ07646 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
MestQ07646 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
MestQ07646 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
MestQ07646 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
MestQ07646 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
MestQ07646 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
MestQ07646 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
MestQ07646 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
MestQ07646 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
MestQ07646 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
MestQ07646 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
MestQ07646 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
MestQ07646 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
MestQ07646 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
MestQ07646 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
MestQ07646 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
MestQ07646 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
MestQ07646 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
MestQ07646 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
MestQ07646 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
MestQ07646 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
MestQ07646 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
MestQ07646 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
MestQ07646 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
MestQ07646 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
MestQ07646 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
MestQ07646 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
MestQ07646 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
MestQ07646 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
MestQ07646 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
MestQ07646 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
MestQ07646 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
MestQ07646 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
MestQ07646 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
MestQ07646 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
MestQ07646 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
MestQ07646 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
MestQ07646 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
MestQ07646 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
MestQ07646 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
MestQ07646 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
MestQ07646 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
MestQ07646 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
MestQ07646 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
MestQ07646 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
MestQ07646 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
MestQ07646 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
MestQ07646 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
MestQ07646 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
MestQ07646 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
MestQ07646 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
MestQ07646 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
MestQ07646 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
MestQ07646 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
MestQ07646 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
MestQ07646 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
MestQ07646 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
MestQ07646 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
MestQ07646 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
MestQ07646 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
MestQ07646 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
MestQ07646 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
MestQ07646 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
MestQ07646 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms