Protein–RNA interactions for Protein: Q07643

Col9a2, Collagen alpha-2(IX) chain, mousemouse

Predictions only

Length 688 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col9a2Q07643 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Col9a2Q07643 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Col9a2Q07643 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Col9a2Q07643 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Col9a2Q07643 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Col9a2Q07643 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Col9a2Q07643 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Col9a2Q07643 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Col9a2Q07643 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Col9a2Q07643 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Col9a2Q07643 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Col9a2Q07643 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Col9a2Q07643 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Col9a2Q07643 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Col9a2Q07643 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Col9a2Q07643 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Col9a2Q07643 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Col9a2Q07643 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Col9a2Q07643 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Col9a2Q07643 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Col9a2Q07643 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Col9a2Q07643 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Col9a2Q07643 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Col9a2Q07643 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Col9a2Q07643 Gm10681-202ENSMUST00000178221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Col9a2Q07643 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Col9a2Q07643 Gm3139-202ENSMUST00000201138 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Col9a2Q07643 Gm3183-203ENSMUST00000202911 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Col9a2Q07643 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Col9a2Q07643 Rad54b-203ENSMUST00000108306 652 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Col9a2Q07643 AA387200-201ENSMUST00000147463 1177 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Col9a2Q07643 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Col9a2Q07643 Aamdc-213ENSMUST00000154853 883 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Col9a2Q07643 Gm16312-201ENSMUST00000156285 362 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Col9a2Q07643 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Col9a2Q07643 Gm25951-201ENSMUST00000175330 64 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Col9a2Q07643 Higd1c-201ENSMUST00000175683 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Col9a2Q07643 Ighv1-48-201ENSMUST00000191795 294 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Col9a2Q07643 AC124457.1-201ENSMUST00000198845 120 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Col9a2Q07643 Gm45113-201ENSMUST00000207518 165 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Col9a2Q07643 CT025551.1-201ENSMUST00000223996 692 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Col9a2Q07643 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Col9a2Q07643 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Col9a2Q07643 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Col9a2Q07643 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Col9a2Q07643 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Col9a2Q07643 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Col9a2Q07643 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Col9a2Q07643 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Col9a2Q07643 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Col9a2Q07643 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Col9a2Q07643 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Col9a2Q07643 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Col9a2Q07643 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Col9a2Q07643 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Col9a2Q07643 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Col9a2Q07643 AC158355.1-201ENSMUST00000215895 1705 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Col9a2Q07643 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Col9a2Q07643 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Col9a2Q07643 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Col9a2Q07643 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Col9a2Q07643 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Col9a2Q07643 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Col9a2Q07643 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Col9a2Q07643 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Col9a2Q07643 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Col9a2Q07643 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Col9a2Q07643 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Col9a2Q07643 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Col9a2Q07643 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Col9a2Q07643 Rps9-204ENSMUST00000108625 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Col9a2Q07643 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Col9a2Q07643 Mir6958-201ENSMUST00000184207 73 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Col9a2Q07643 Stpg4-202ENSMUST00000186211 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Col9a2Q07643 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Col9a2Q07643 Timm9-201ENSMUST00000021486 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Col9a2Q07643 AC135469.1-201ENSMUST00000225984 772 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Col9a2Q07643 CT030637.1-201ENSMUST00000228016 669 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Col9a2Q07643 Emp3-201ENSMUST00000038876 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Col9a2Q07643 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Col9a2Q07643 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Col9a2Q07643 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Col9a2Q07643 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Col9a2Q07643 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Col9a2Q07643 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Col9a2Q07643 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Col9a2Q07643 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Col9a2Q07643 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Col9a2Q07643 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Col9a2Q07643 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Col9a2Q07643 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Col9a2Q07643 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Col9a2Q07643 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Col9a2Q07643 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Col9a2Q07643 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Col9a2Q07643 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Col9a2Q07643 Fam129a-203ENSMUST00000111875 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Col9a2Q07643 2900011O08Rik-202ENSMUST00000118412 954 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Col9a2Q07643 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Col9a2Q07643 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59 ms