Protein–RNA interactions for Protein: Q00977

Gjb2, Gap junction beta-2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb2Q00977 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gjb2Q00977 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gjb2Q00977 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gjb2Q00977 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gjb2Q00977 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gjb2Q00977 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gjb2Q00977 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gjb2Q00977 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gjb2Q00977 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gjb2Q00977 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gjb2Q00977 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gjb2Q00977 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gjb2Q00977 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Gjb2Q00977 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Gjb2Q00977 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gjb2Q00977 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gjb2Q00977 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gjb2Q00977 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gjb2Q00977 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gjb2Q00977 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gjb2Q00977 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gjb2Q00977 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gjb2Q00977 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gjb2Q00977 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Gjb2Q00977 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gjb2Q00977 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Gjb2Q00977 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Gjb2Q00977 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Gjb2Q00977 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Gjb2Q00977 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gjb2Q00977 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gjb2Q00977 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gjb2Q00977 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gjb2Q00977 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gjb2Q00977 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gjb2Q00977 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gjb2Q00977 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Gjb2Q00977 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gjb2Q00977 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gjb2Q00977 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gjb2Q00977 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gjb2Q00977 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gjb2Q00977 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gjb2Q00977 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gjb2Q00977 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gjb2Q00977 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gjb2Q00977 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Gjb2Q00977 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gjb2Q00977 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gjb2Q00977 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gjb2Q00977 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gjb2Q00977 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gjb2Q00977 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gjb2Q00977 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gjb2Q00977 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gjb2Q00977 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gjb2Q00977 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gjb2Q00977 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gjb2Q00977 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gjb2Q00977 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gjb2Q00977 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gjb2Q00977 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gjb2Q00977 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gjb2Q00977 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Gjb2Q00977 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gjb2Q00977 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gjb2Q00977 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gjb2Q00977 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gjb2Q00977 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gjb2Q00977 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gjb2Q00977 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gjb2Q00977 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gjb2Q00977 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gjb2Q00977 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gjb2Q00977 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gjb2Q00977 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gjb2Q00977 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gjb2Q00977 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gjb2Q00977 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gjb2Q00977 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gjb2Q00977 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gjb2Q00977 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gjb2Q00977 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gjb2Q00977 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gjb2Q00977 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gjb2Q00977 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gjb2Q00977 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gjb2Q00977 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gjb2Q00977 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gjb2Q00977 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gjb2Q00977 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gjb2Q00977 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gjb2Q00977 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gjb2Q00977 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Gjb2Q00977 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gjb2Q00977 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gjb2Q00977 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gjb2Q00977 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gjb2Q00977 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gjb2Q00977 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms