Protein–RNA interactions for Protein: P63139

Nfyb, Nuclear transcription factor Y subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfybP63139 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
NfybP63139 Pif1-203ENSMUST00000134538 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
NfybP63139 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
NfybP63139 Nfic-201ENSMUST00000020461 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
NfybP63139 Crispld2-202ENSMUST00000108972 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
NfybP63139 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
NfybP63139 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
NfybP63139 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
NfybP63139 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
NfybP63139 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
NfybP63139 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
NfybP63139 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
NfybP63139 Fam84a-201ENSMUST00000020926 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
NfybP63139 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
NfybP63139 Chek1-202ENSMUST00000172702 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
NfybP63139 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
NfybP63139 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
NfybP63139 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
NfybP63139 Vasn-201ENSMUST00000038770 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
NfybP63139 Nap1l3-201ENSMUST00000079490 2837 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
NfybP63139 Npas2-201ENSMUST00000056815 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
NfybP63139 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
NfybP63139 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
NfybP63139 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
NfybP63139 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
NfybP63139 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
NfybP63139 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
NfybP63139 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
NfybP63139 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
NfybP63139 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
NfybP63139 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
NfybP63139 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
NfybP63139 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
NfybP63139 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
NfybP63139 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
NfybP63139 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
NfybP63139 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
NfybP63139 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
NfybP63139 Cfap74-209ENSMUST00000151083 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
NfybP63139 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
NfybP63139 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
NfybP63139 Ccdc189-201ENSMUST00000072155 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
NfybP63139 Cxcl12-203ENSMUST00000112871 3132 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
NfybP63139 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
NfybP63139 Tubgcp6-201ENSMUST00000041656 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
NfybP63139 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
NfybP63139 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
NfybP63139 Sptan1-204ENSMUST00000113717 7958 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
NfybP63139 Tacc2-205ENSMUST00000207282 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
NfybP63139 Parvg-207ENSMUST00000163667 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
NfybP63139 Gm26778-201ENSMUST00000181443 3805 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
NfybP63139 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
NfybP63139 Morc3-206ENSMUST00000202261 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
NfybP63139 Morc3-201ENSMUST00000044068 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
NfybP63139 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
NfybP63139 Cep250-202ENSMUST00000094421 7919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
NfybP63139 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
NfybP63139 Smim1-214ENSMUST00000182191 3535 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
NfybP63139 Itsn2-211ENSMUST00000219007 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
NfybP63139 Hnrnph2-203ENSMUST00000074950 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
NfybP63139 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
NfybP63139 Npepps-201ENSMUST00000001480 4215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
NfybP63139 Rpap1-202ENSMUST00000099529 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
NfybP63139 Dock6-207ENSMUST00000217336 6880 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
NfybP63139 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
NfybP63139 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
NfybP63139 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
NfybP63139 Akap12-202ENSMUST00000215696 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
NfybP63139 Slc5a8-201ENSMUST00000020255 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
NfybP63139 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
NfybP63139 Myh2-201ENSMUST00000018641 6018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
NfybP63139 Prkcd-205ENSMUST00000112207 2139 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
NfybP63139 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
NfybP63139 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
NfybP63139 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
NfybP63139 Mknk1-202ENSMUST00000106513 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
NfybP63139 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
NfybP63139 Trim25-201ENSMUST00000000284 5566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
NfybP63139 Fam120b-201ENSMUST00000055352 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
NfybP63139 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
NfybP63139 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
NfybP63139 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
NfybP63139 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
NfybP63139 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
NfybP63139 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
NfybP63139 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
NfybP63139 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
NfybP63139 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
NfybP63139 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
NfybP63139 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
NfybP63139 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
NfybP63139 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
NfybP63139 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
NfybP63139 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
NfybP63139 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
NfybP63139 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
NfybP63139 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
NfybP63139 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
NfybP63139 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
NfybP63139 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.7 ms