Protein–RNA interactions for Protein: P59054

Csrnp1, Cysteine/serine-rich nuclear protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csrnp1P59054 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Csrnp1P59054 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Csrnp1P59054 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Csrnp1P59054 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Csrnp1P59054 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Csrnp1P59054 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Csrnp1P59054 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Csrnp1P59054 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Csrnp1P59054 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Csrnp1P59054 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Csrnp1P59054 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Csrnp1P59054 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Csrnp1P59054 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Csrnp1P59054 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Csrnp1P59054 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Csrnp1P59054 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Csrnp1P59054 Gm5136-201ENSMUST00000218023 1397 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Csrnp1P59054 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Csrnp1P59054 Rpsa-ps4-201ENSMUST00000121691 888 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Csrnp1P59054 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Csrnp1P59054 4930562C15Rik-202ENSMUST00000171105 1299 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Csrnp1P59054 Gm17831-201ENSMUST00000205579 900 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Csrnp1P59054 Gm9463-201ENSMUST00000206707 601 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Csrnp1P59054 Gm31479-201ENSMUST00000209936 522 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Csrnp1P59054 AC154290.1-201ENSMUST00000223786 1240 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Csrnp1P59054 AC171241.1-201ENSMUST00000228144 1166 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Csrnp1P59054 Tff1-201ENSMUST00000024831 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Csrnp1P59054 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Csrnp1P59054 Actg-ps1-201ENSMUST00000099636 1124 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Csrnp1P59054 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Csrnp1P59054 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Csrnp1P59054 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Csrnp1P59054 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Csrnp1P59054 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Csrnp1P59054 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Csrnp1P59054 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Csrnp1P59054 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Csrnp1P59054 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Csrnp1P59054 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Csrnp1P59054 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Csrnp1P59054 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Csrnp1P59054 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Csrnp1P59054 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Csrnp1P59054 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Csrnp1P59054 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Csrnp1P59054 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Csrnp1P59054 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Csrnp1P59054 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Csrnp1P59054 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Csrnp1P59054 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Csrnp1P59054 Platr7-201ENSMUST00000181466 1334 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Csrnp1P59054 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Csrnp1P59054 Gm14314-201ENSMUST00000118225 1015 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Csrnp1P59054 Gm11956-201ENSMUST00000119525 512 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Csrnp1P59054 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Csrnp1P59054 Rbm18-202ENSMUST00000122456 781 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Csrnp1P59054 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Csrnp1P59054 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Csrnp1P59054 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Csrnp1P59054 8030442B05Rik-201ENSMUST00000192626 1035 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Csrnp1P59054 Gm10752-201ENSMUST00000218348 729 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Csrnp1P59054 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Csrnp1P59054 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Csrnp1P59054 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Csrnp1P59054 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Csrnp1P59054 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Csrnp1P59054 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Csrnp1P59054 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Csrnp1P59054 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Csrnp1P59054 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Csrnp1P59054 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Csrnp1P59054 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Csrnp1P59054 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Csrnp1P59054 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Csrnp1P59054 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Csrnp1P59054 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Csrnp1P59054 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Csrnp1P59054 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Csrnp1P59054 Gm5795-201ENSMUST00000100920 984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Csrnp1P59054 Ighv1-61-201ENSMUST00000103531 351 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Csrnp1P59054 Tsc22d4-204ENSMUST00000110983 1043 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Csrnp1P59054 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Csrnp1P59054 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Csrnp1P59054 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Csrnp1P59054 Gm3685-201ENSMUST00000169215 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Csrnp1P59054 Gm5778-201ENSMUST00000171003 1072 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Csrnp1P59054 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Csrnp1P59054 Emp3-201ENSMUST00000038876 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Csrnp1P59054 Orc4-202ENSMUST00000090976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Csrnp1P59054 Gm10338-201ENSMUST00000096148 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Csrnp1P59054 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Csrnp1P59054 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Csrnp1P59054 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Csrnp1P59054 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Csrnp1P59054 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Csrnp1P59054 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Csrnp1P59054 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Csrnp1P59054 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Csrnp1P59054 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Csrnp1P59054 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms