Protein–RNA interactions for Protein: P56916

Gsc2, Homeobox protein goosecoid-2, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gsc2P56916 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gsc2P56916 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gsc2P56916 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gsc2P56916 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gsc2P56916 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gsc2P56916 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gsc2P56916 Rab3gap2-201ENSMUST00000069652 7052 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gsc2P56916 Klhl3-201ENSMUST00000091583 6871 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gsc2P56916 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gsc2P56916 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gsc2P56916 Tmem151a-201ENSMUST00000077066 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gsc2P56916 Tcof1-204ENSMUST00000176630 4529 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gsc2P56916 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gsc2P56916 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gsc2P56916 Arpp21-223ENSMUST00000162097 3952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gsc2P56916 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gsc2P56916 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gsc2P56916 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gsc2P56916 Lamb1-201ENSMUST00000002979 5784 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gsc2P56916 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gsc2P56916 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gsc2P56916 Myh13-201ENSMUST00000081911 5817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gsc2P56916 Spata31d1a-203ENSMUST00000224982 5325 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gsc2P56916 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gsc2P56916 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gsc2P56916 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gsc2P56916 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gsc2P56916 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gsc2P56916 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gsc2P56916 Tacr1-201ENSMUST00000032122 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gsc2P56916 Gnas-203ENSMUST00000087876 3719 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gsc2P56916 Slco2a1-201ENSMUST00000035148 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gsc2P56916 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gsc2P56916 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gsc2P56916 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gsc2P56916 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gsc2P56916 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gsc2P56916 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gsc2P56916 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gsc2P56916 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gsc2P56916 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gsc2P56916 9430065F17Rik-202ENSMUST00000180908 1084 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gsc2P56916 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gsc2P56916 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gsc2P56916 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gsc2P56916 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gsc2P56916 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gsc2P56916 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gsc2P56916 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gsc2P56916 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gsc2P56916 Fam151b-201ENSMUST00000040106 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gsc2P56916 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gsc2P56916 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gsc2P56916 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gsc2P56916 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gsc2P56916 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gsc2P56916 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gsc2P56916 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gsc2P56916 Rims1-203ENSMUST00000097809 6179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gsc2P56916 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gsc2P56916 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gsc2P56916 Synpo2l-202ENSMUST00000117386 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gsc2P56916 Samd4-206ENSMUST00000137543 6874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gsc2P56916 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gsc2P56916 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gsc2P56916 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gsc2P56916 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gsc2P56916 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gsc2P56916 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gsc2P56916 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gsc2P56916 Gtf2i-224ENSMUST00000174772 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gsc2P56916 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gsc2P56916 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gsc2P56916 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gsc2P56916 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gsc2P56916 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gsc2P56916 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gsc2P56916 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gsc2P56916 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gsc2P56916 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gsc2P56916 Nipbl-201ENSMUST00000052965 8815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gsc2P56916 Ifna2-201ENSMUST00000105147 1032 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gsc2P56916 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gsc2P56916 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gsc2P56916 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Gsc2P56916 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Gsc2P56916 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Gsc2P56916 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gsc2P56916 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gsc2P56916 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gsc2P56916 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Gsc2P56916 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gsc2P56916 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gsc2P56916 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gsc2P56916 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gsc2P56916 Gm43084-201ENSMUST00000200696 947 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Gsc2P56916 Gm43452-201ENSMUST00000201873 991 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Gsc2P56916 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gsc2P56916 Gm45610-201ENSMUST00000209227 784 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Gsc2P56916 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.8 ms