Protein–RNA interactions for Protein: P35123

Usp4, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 4, mousemouse

Predictions only

Length 962 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp4P35123 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Usp4P35123 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Usp4P35123 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Usp4P35123 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Usp4P35123 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Usp4P35123 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Usp4P35123 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Usp4P35123 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Usp4P35123 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Usp4P35123 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Usp4P35123 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Usp4P35123 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Usp4P35123 Gm10686-201ENSMUST00000215389 3247 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Usp4P35123 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Usp4P35123 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Usp4P35123 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Usp4P35123 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Usp4P35123 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Usp4P35123 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Usp4P35123 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Usp4P35123 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Usp4P35123 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Usp4P35123 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Usp4P35123 Gm12953-201ENSMUST00000138426 751 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Usp4P35123 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Usp4P35123 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Usp4P35123 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Usp4P35123 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Usp4P35123 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Usp4P35123 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Usp4P35123 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Usp4P35123 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Usp4P35123 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Usp4P35123 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Usp4P35123 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Usp4P35123 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Usp4P35123 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Usp4P35123 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Usp4P35123 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Usp4P35123 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Usp4P35123 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Usp4P35123 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Usp4P35123 Mlc1-201ENSMUST00000042594 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Usp4P35123 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Usp4P35123 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Usp4P35123 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Usp4P35123 Far2-201ENSMUST00000032443 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Usp4P35123 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Usp4P35123 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Usp4P35123 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Usp4P35123 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Usp4P35123 Olfr482-202ENSMUST00000217304 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Usp4P35123 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Usp4P35123 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Usp4P35123 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Usp4P35123 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Usp4P35123 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Usp4P35123 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Usp4P35123 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Usp4P35123 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Usp4P35123 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Usp4P35123 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Usp4P35123 Mmp25-201ENSMUST00000024696 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Usp4P35123 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Usp4P35123 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Usp4P35123 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Usp4P35123 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Usp4P35123 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Usp4P35123 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Usp4P35123 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Usp4P35123 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Usp4P35123 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Usp4P35123 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Usp4P35123 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Usp4P35123 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Usp4P35123 4833420G17Rik-204ENSMUST00000225186 2627 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Usp4P35123 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Usp4P35123 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Usp4P35123 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Usp4P35123 Cep97-203ENSMUST00000118500 3389 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Usp4P35123 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Usp4P35123 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Usp4P35123 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Usp4P35123 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Usp4P35123 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Usp4P35123 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Usp4P35123 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Usp4P35123 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Usp4P35123 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Usp4P35123 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Usp4P35123 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Usp4P35123 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Usp4P35123 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Usp4P35123 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Usp4P35123 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Usp4P35123 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Usp4P35123 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Usp4P35123 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Usp4P35123 Tnc-202ENSMUST00000107371 2928 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Usp4P35123 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
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