Protein–RNA interactions for Protein: P28705

Rxrg, Retinoic acid receptor RXR-gamma, mousemouse

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Length 463 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxrgP28705 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
RxrgP28705 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC12.15□□□□□ -0.46
RxrgP28705 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
RxrgP28705 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
RxrgP28705 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
RxrgP28705 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
RxrgP28705 Gm22334-201ENSMUST00000158070 133 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
RxrgP28705 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
RxrgP28705 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
RxrgP28705 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
RxrgP28705 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
RxrgP28705 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
RxrgP28705 Rpl10a-201ENSMUST00000042334 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
RxrgP28705 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
RxrgP28705 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC12.15□□□□□ -0.46
RxrgP28705 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
RxrgP28705 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
RxrgP28705 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
RxrgP28705 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
RxrgP28705 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
RxrgP28705 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
RxrgP28705 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
RxrgP28705 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
RxrgP28705 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
RxrgP28705 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
RxrgP28705 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
RxrgP28705 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
RxrgP28705 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
RxrgP28705 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
RxrgP28705 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC12.15□□□□□ -0.47
RxrgP28705 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
RxrgP28705 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC12.15□□□□□ -0.47
RxrgP28705 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
RxrgP28705 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
RxrgP28705 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
RxrgP28705 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
RxrgP28705 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
RxrgP28705 Plg-201ENSMUST00000014578 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
RxrgP28705 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
RxrgP28705 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
RxrgP28705 Slc17a5-202ENSMUST00000117645 3114 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
RxrgP28705 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
RxrgP28705 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
RxrgP28705 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
RxrgP28705 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
RxrgP28705 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
RxrgP28705 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
RxrgP28705 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
RxrgP28705 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
RxrgP28705 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
RxrgP28705 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
RxrgP28705 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
RxrgP28705 Gm24514-201ENSMUST00000174961 285 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
RxrgP28705 Gm8546-201ENSMUST00000178288 1264 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
RxrgP28705 Gm5523-201ENSMUST00000180415 997 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
RxrgP28705 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
RxrgP28705 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
RxrgP28705 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
RxrgP28705 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
RxrgP28705 Anxa7-202ENSMUST00000100844 2904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
RxrgP28705 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
RxrgP28705 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
RxrgP28705 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
RxrgP28705 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
RxrgP28705 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
RxrgP28705 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
RxrgP28705 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
RxrgP28705 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
RxrgP28705 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
RxrgP28705 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
RxrgP28705 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
RxrgP28705 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
RxrgP28705 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
RxrgP28705 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
RxrgP28705 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
RxrgP28705 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
RxrgP28705 Zc3h18-205ENSMUST00000176629 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
RxrgP28705 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
RxrgP28705 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
RxrgP28705 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
RxrgP28705 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
RxrgP28705 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
RxrgP28705 Hexim1-201ENSMUST00000053063 3495 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
RxrgP28705 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
RxrgP28705 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
RxrgP28705 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
RxrgP28705 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
RxrgP28705 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
RxrgP28705 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
RxrgP28705 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
RxrgP28705 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
RxrgP28705 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
RxrgP28705 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
RxrgP28705 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
RxrgP28705 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
RxrgP28705 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
RxrgP28705 Uqcc1-203ENSMUST00000109632 2313 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
RxrgP28705 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
RxrgP28705 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
RxrgP28705 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
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