Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 Hpgd-201ENSMUST00000034026 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxd10P28359 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Hoxd10P28359 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Hoxd10P28359 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Hoxd10P28359 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Hoxd10P28359 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Hoxd10P28359 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Hoxd10P28359 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Hoxd10P28359 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Hoxd10P28359 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Hoxd10P28359 Gm2000-201ENSMUST00000102782 445 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hoxd10P28359 Trav13d-1-201ENSMUST00000103588 396 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hoxd10P28359 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hoxd10P28359 Gm11560-201ENSMUST00000117567 948 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Hoxd10P28359 Bach2it1-201ENSMUST00000133451 481 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hoxd10P28359 Gm15409-201ENSMUST00000135240 520 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hoxd10P28359 Gm12682-201ENSMUST00000144637 1081 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hoxd10P28359 Gm17214-201ENSMUST00000164501 541 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Hoxd10P28359 Nudt12-203ENSMUST00000174122 1244 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hoxd10P28359 Vmn1r-ps63-201ENSMUST00000174565 989 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Hoxd10P28359 B230110C06Rik-201ENSMUST00000181388 1274 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hoxd10P28359 Gm35025-203ENSMUST00000193519 634 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hoxd10P28359 Gm43695-201ENSMUST00000196545 196 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hoxd10P28359 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hoxd10P28359 1700086D15Rik-201ENSMUST00000020855 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hoxd10P28359 Gm4065-202ENSMUST00000218911 986 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hoxd10P28359 AC153962.2-201ENSMUST00000219417 550 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Hoxd10P28359 Tex35-201ENSMUST00000027884 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hoxd10P28359 Ccdc28b-201ENSMUST00000030586 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hoxd10P28359 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hoxd10P28359 Lxn-201ENSMUST00000058981 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hoxd10P28359 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hoxd10P28359 Capzb-201ENSMUST00000030518 1390 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hoxd10P28359 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hoxd10P28359 Gm15513-201ENSMUST00000140646 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hoxd10P28359 Abi2-205ENSMUST00000187709 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hoxd10P28359 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hoxd10P28359 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hoxd10P28359 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hoxd10P28359 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hoxd10P28359 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hoxd10P28359 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hoxd10P28359 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hoxd10P28359 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hoxd10P28359 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hoxd10P28359 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hoxd10P28359 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hoxd10P28359 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxd10P28359 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxd10P28359 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxd10P28359 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxd10P28359 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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Hoxd10P28359 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxd10P28359 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxd10P28359 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxd10P28359 Gm14718-201ENSMUST00000138082 752 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxd10P28359 Gm11789-203ENSMUST00000140645 737 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxd10P28359 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxd10P28359 Gm14266-202ENSMUST00000146542 1067 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxd10P28359 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxd10P28359 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxd10P28359 Gm12198-201ENSMUST00000154068 1809 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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Hoxd10P28359 Gm8701-201ENSMUST00000169259 874 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxd10P28359 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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Hoxd10P28359 Zfp1-202ENSMUST00000211926 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxd10P28359 Gm6390-201ENSMUST00000215034 589 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
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Hoxd10P28359 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxd10P28359 Dydc2-201ENSMUST00000022316 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxd10P28359 Olfr335-ps-201ENSMUST00000223545 939 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxd10P28359 Zmiz1os1-202ENSMUST00000225188 1223 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxd10P28359 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxd10P28359 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxd10P28359 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxd10P28359 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxd10P28359 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxd10P28359 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxd10P28359 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxd10P28359 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxd10P28359 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxd10P28359 Gm19680-201ENSMUST00000095050 1513 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxd10P28359 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxd10P28359 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxd10P28359 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxd10P28359 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxd10P28359 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxd10P28359 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxd10P28359 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxd10P28359 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxd10P28359 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxd10P28359 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxd10P28359 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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