Protein–RNA interactions for Protein: P28230

Gjb1, Gap junction beta-1 protein, mousemouse

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Length 283 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb1P28230 Clec7a-202ENSMUST00000184581 707 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gjb1P28230 Gm9916-201ENSMUST00000192943 1228 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Gjb1P28230 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gjb1P28230 Stt3a-209ENSMUST00000217599 285 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gjb1P28230 9430078K24Rik-203ENSMUST00000220293 638 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gjb1P28230 Gm40879-201ENSMUST00000220759 612 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Gjb1P28230 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gjb1P28230 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Gjb1P28230 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gjb1P28230 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Gjb1P28230 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gjb1P28230 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gjb1P28230 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gjb1P28230 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gjb1P28230 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Gjb1P28230 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gjb1P28230 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gjb1P28230 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gjb1P28230 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gjb1P28230 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gjb1P28230 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gjb1P28230 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gjb1P28230 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gjb1P28230 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gjb1P28230 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Gjb1P28230 Etv1-205ENSMUST00000160856 1474 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gjb1P28230 Spdye4a-203ENSMUST00000195900 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gjb1P28230 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gjb1P28230 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gjb1P28230 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Gjb1P28230 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gjb1P28230 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gjb1P28230 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gjb1P28230 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gjb1P28230 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gjb1P28230 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gjb1P28230 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gjb1P28230 Klk6-201ENSMUST00000107966 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gjb1P28230 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gjb1P28230 Gm14892-201ENSMUST00000117636 267 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Gjb1P28230 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gjb1P28230 Spaca9-202ENSMUST00000124840 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gjb1P28230 Apobr-203ENSMUST00000137646 457 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gjb1P28230 Gm15985-201ENSMUST00000137731 343 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gjb1P28230 Gm17214-201ENSMUST00000164501 541 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Gjb1P28230 Gm29560-201ENSMUST00000191526 881 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gjb1P28230 Gm8342-201ENSMUST00000209839 757 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Gjb1P28230 Gm3433-201ENSMUST00000210149 1058 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Gjb1P28230 Gm45527-201ENSMUST00000211052 774 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Gjb1P28230 Gm6390-201ENSMUST00000215034 589 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Gjb1P28230 BC106175-202ENSMUST00000219344 1213 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Gjb1P28230 AC113282.2-201ENSMUST00000224012 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gjb1P28230 AC113282.3-201ENSMUST00000224757 942 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gjb1P28230 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gjb1P28230 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gjb1P28230 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gjb1P28230 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gjb1P28230 Tmem237-205ENSMUST00000186794 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gjb1P28230 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gjb1P28230 Hddc3-201ENSMUST00000032747 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gjb1P28230 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gjb1P28230 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gjb1P28230 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gjb1P28230 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gjb1P28230 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gjb1P28230 Zfp1-202ENSMUST00000211926 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gjb1P28230 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gjb1P28230 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gjb1P28230 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gjb1P28230 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gjb1P28230 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gjb1P28230 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gjb1P28230 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gjb1P28230 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gjb1P28230 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Gjb1P28230 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gjb1P28230 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gjb1P28230 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gjb1P28230 Gm15622-201ENSMUST00000143025 1464 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gjb1P28230 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gjb1P28230 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gjb1P28230 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gjb1P28230 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gjb1P28230 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gjb1P28230 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gjb1P28230 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gjb1P28230 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gjb1P28230 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gjb1P28230 Art5-202ENSMUST00000106934 843 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gjb1P28230 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Gjb1P28230 Gm12453-201ENSMUST00000121981 331 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Gjb1P28230 Rpl9-ps7-201ENSMUST00000140507 579 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Gjb1P28230 Gm12682-201ENSMUST00000144637 1081 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gjb1P28230 Gm3150-201ENSMUST00000166418 204 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Gjb1P28230 E030018B13Rik-201ENSMUST00000177638 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gjb1P28230 Isoc2b-205ENSMUST00000208816 820 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gjb1P28230 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gjb1P28230 Acot13-201ENSMUST00000006900 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gjb1P28230 Rpl9-ps4-201ENSMUST00000075549 579 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Gjb1P28230 Gm16380-201ENSMUST00000077997 478 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
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