Protein–RNA interactions for Protein: P27664

Pde6a, Rod cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha, mousemouse

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Length 859 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6aP27664 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pde6aP27664 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pde6aP27664 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pde6aP27664 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pde6aP27664 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pde6aP27664 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pde6aP27664 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pde6aP27664 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Pde6aP27664 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Pde6aP27664 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pde6aP27664 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Pde6aP27664 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pde6aP27664 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pde6aP27664 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pde6aP27664 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pde6aP27664 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pde6aP27664 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pde6aP27664 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pde6aP27664 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pde6aP27664 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pde6aP27664 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pde6aP27664 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pde6aP27664 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pde6aP27664 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Pde6aP27664 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Pde6aP27664 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pde6aP27664 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pde6aP27664 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pde6aP27664 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pde6aP27664 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pde6aP27664 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pde6aP27664 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pde6aP27664 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pde6aP27664 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pde6aP27664 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pde6aP27664 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pde6aP27664 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pde6aP27664 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pde6aP27664 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pde6aP27664 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pde6aP27664 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pde6aP27664 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pde6aP27664 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pde6aP27664 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pde6aP27664 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Pde6aP27664 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pde6aP27664 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pde6aP27664 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pde6aP27664 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pde6aP27664 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pde6aP27664 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pde6aP27664 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pde6aP27664 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Pde6aP27664 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pde6aP27664 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pde6aP27664 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Pde6aP27664 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pde6aP27664 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pde6aP27664 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Pde6aP27664 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pde6aP27664 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pde6aP27664 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pde6aP27664 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pde6aP27664 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pde6aP27664 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Pde6aP27664 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pde6aP27664 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Pde6aP27664 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Pde6aP27664 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Pde6aP27664 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Pde6aP27664 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.19
Pde6aP27664 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pde6aP27664 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pde6aP27664 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pde6aP27664 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pde6aP27664 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pde6aP27664 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pde6aP27664 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pde6aP27664 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pde6aP27664 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pde6aP27664 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pde6aP27664 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pde6aP27664 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pde6aP27664 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pde6aP27664 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Pde6aP27664 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pde6aP27664 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Pde6aP27664 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Pde6aP27664 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pde6aP27664 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pde6aP27664 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pde6aP27664 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pde6aP27664 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Pde6aP27664 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Pde6aP27664 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Pde6aP27664 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pde6aP27664 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pde6aP27664 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pde6aP27664 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Pde6aP27664 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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