Protein–RNA interactions for Protein: P18524

Ig heavy chain V region RF, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18524 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
P18524 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
P18524 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
P18524 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
P18524 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
P18524 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
P18524 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
P18524 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
P18524 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
P18524 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
P18524 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
P18524 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
P18524 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
P18524 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
P18524 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
P18524 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
P18524 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
P18524 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
P18524 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
P18524 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
P18524 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
P18524 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
P18524 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
P18524 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
P18524 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
P18524 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
P18524 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
P18524 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
P18524 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
P18524 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
P18524 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
P18524 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
P18524 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
P18524 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
P18524 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
P18524 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
P18524 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
P18524 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
P18524 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
P18524 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
P18524 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
P18524 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
P18524 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
P18524 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
P18524 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
P18524 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
P18524 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
P18524 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
P18524 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
P18524 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
P18524 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
P18524 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
P18524 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
P18524 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
P18524 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
P18524 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
P18524 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
P18524 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
P18524 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
P18524 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
P18524 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
P18524 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
P18524 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
P18524 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
P18524 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
P18524 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
P18524 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
P18524 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
P18524 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
P18524 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
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P18524 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
P18524 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
P18524 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
P18524 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
P18524 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
P18524 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
P18524 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
P18524 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
P18524 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
P18524 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
P18524 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
P18524 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
P18524 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
P18524 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
P18524 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
P18524 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
P18524 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
P18524 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
P18524 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
P18524 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
P18524 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
P18524 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
P18524 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
P18524 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
P18524 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
P18524 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
P18524 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
P18524 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
P18524 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.6 ms