Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 Zfp68-203ENSMUST00000110905 4749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 Zfp646-201ENSMUST00000050383 6310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 Ptbp1-206ENSMUST00000165704 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 Plcd4-206ENSMUST00000113750 2692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 Pnma2-201ENSMUST00000089236 5518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 Gm26541-201ENSMUST00000181866 3973 ntTSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 Ipo4-201ENSMUST00000047131 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 Ankrd31-203ENSMUST00000208758 5859 ntTSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 Gm13398-201ENSMUST00000149378 2837 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 Zfp54-202ENSMUST00000165230 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 Gm3294-201ENSMUST00000164104 7367 ntTSL 3 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 Tuft1-204ENSMUST00000196733 2555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 Slc36a4-201ENSMUST00000061568 6539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 Styx-205ENSMUST00000226873 12974 ntAPPRIS P1 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 Kif1b-203ENSMUST00000060537 10233 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 Epha6-201ENSMUST00000068860 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 S1pr2-201ENSMUST00000054197 6394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 Cabin1-201ENSMUST00000001712 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 Thg1l-201ENSMUST00000011398 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 Pde2a-201ENSMUST00000163751 4218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 Pou1f1-201ENSMUST00000004964 1773 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 Scn8a-203ENSMUST00000108908 7030 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 Med24-202ENSMUST00000100500 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 Hyou1-206ENSMUST00000161318 4489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 Arid2-201ENSMUST00000096250 8507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 Wnk1-224ENSMUST00000203030 8163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 Olfr764-ps1-201ENSMUST00000204763 2854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 Myo18a-223ENSMUST00000169105 6475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 Vwa5b2-202ENSMUST00000096197 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 Sla2-202ENSMUST00000109561 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 Ctnnd1-223ENSMUST00000111697 5294 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 D130017N08Rik-203ENSMUST00000196629 2265 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 Tbcel-203ENSMUST00000125995 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.9 ms