Protein–RNA interactions for Protein: O35451

Atf6b, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-6 beta, mousemouse

Predictions only

Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf6bO35451 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Atf6bO35451 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Atf6bO35451 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Atf6bO35451 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Atf6bO35451 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Atf6bO35451 Igfbp5-201ENSMUST00000027377 6006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Atf6bO35451 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Atf6bO35451 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Atf6bO35451 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Atf6bO35451 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Atf6bO35451 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Atf6bO35451 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Atf6bO35451 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Atf6bO35451 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Atf6bO35451 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Atf6bO35451 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Atf6bO35451 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Atf6bO35451 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Atf6bO35451 Ippk-201ENSMUST00000021817 2856 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Atf6bO35451 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Atf6bO35451 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Atf6bO35451 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Atf6bO35451 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Atf6bO35451 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Atf6bO35451 Ctnnd1-204ENSMUST00000099941 5783 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Atf6bO35451 Nsl1-202ENSMUST00000078259 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Atf6bO35451 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Atf6bO35451 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Atf6bO35451 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Atf6bO35451 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Atf6bO35451 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Atf6bO35451 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Atf6bO35451 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Atf6bO35451 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Atf6bO35451 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Atf6bO35451 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Atf6bO35451 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Atf6bO35451 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Atf6bO35451 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Atf6bO35451 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Atf6bO35451 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Atf6bO35451 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Atf6bO35451 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Atf6bO35451 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Atf6bO35451 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Atf6bO35451 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Atf6bO35451 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Atf6bO35451 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Atf6bO35451 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Atf6bO35451 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Atf6bO35451 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Atf6bO35451 Madd-208ENSMUST00000111370 5879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Atf6bO35451 Madd-214ENSMUST00000111381 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Atf6bO35451 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Atf6bO35451 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Atf6bO35451 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Atf6bO35451 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Atf6bO35451 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Atf6bO35451 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Atf6bO35451 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Atf6bO35451 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Atf6bO35451 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Atf6bO35451 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Atf6bO35451 Gm10686-201ENSMUST00000215389 3247 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Atf6bO35451 Madd-207ENSMUST00000111369 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Atf6bO35451 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Atf6bO35451 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Atf6bO35451 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Atf6bO35451 Slx4ip-206ENSMUST00000180277 2723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Atf6bO35451 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Atf6bO35451 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Atf6bO35451 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Atf6bO35451 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Atf6bO35451 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Atf6bO35451 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Atf6bO35451 Plin4-201ENSMUST00000002908 5755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Atf6bO35451 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Atf6bO35451 Col4a3-201ENSMUST00000113457 8554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Atf6bO35451 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Atf6bO35451 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Atf6bO35451 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Atf6bO35451 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Atf6bO35451 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Atf6bO35451 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Atf6bO35451 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Atf6bO35451 Zdbf2-202ENSMUST00000114132 12629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Atf6bO35451 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Atf6bO35451 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Atf6bO35451 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Atf6bO35451 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Atf6bO35451 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Atf6bO35451 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Atf6bO35451 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Atf6bO35451 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Atf6bO35451 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Atf6bO35451 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Atf6bO35451 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Atf6bO35451 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Atf6bO35451 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Atf6bO35451 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms