Protein–RNA interactions for Protein: O35449

Prrt1, Proline-rich transmembrane protein 1, mousemouse

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Length 306 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt1O35449 Rdh13-201ENSMUST00000008579 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Prrt1O35449 Elavl2-207ENSMUST00000107118 3797 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Prrt1O35449 Ccpg1-201ENSMUST00000037977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Prrt1O35449 Prdm16-203ENSMUST00000097759 8544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Prrt1O35449 Trim61-201ENSMUST00000078409 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Prrt1O35449 Ccm2-202ENSMUST00000109721 1551 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Prrt1O35449 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Prrt1O35449 Epha6-201ENSMUST00000068860 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Prrt1O35449 Aoc2-201ENSMUST00000041095 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Prrt1O35449 Glyctk-202ENSMUST00000112543 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Prrt1O35449 Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Prrt1O35449 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Prrt1O35449 Clcn4-201ENSMUST00000000619 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Prrt1O35449 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Prrt1O35449 Anp32e-204ENSMUST00000168106 2890 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Prrt1O35449 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Prrt1O35449 Gm38292-201ENSMUST00000192646 3045 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Prrt1O35449 4930463O16Rik-201ENSMUST00000020222 2088 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Prrt1O35449 Scpep1-201ENSMUST00000000287 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Prrt1O35449 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Prrt1O35449 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Prrt1O35449 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Prrt1O35449 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Prrt1O35449 Zfp236-202ENSMUST00000182122 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Prrt1O35449 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Prrt1O35449 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Prrt1O35449 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Prrt1O35449 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Prrt1O35449 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Prrt1O35449 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Prrt1O35449 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Prrt1O35449 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Prrt1O35449 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Prrt1O35449 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Prrt1O35449 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Prrt1O35449 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Prrt1O35449 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Prrt1O35449 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Prrt1O35449 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Prrt1O35449 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Prrt1O35449 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Prrt1O35449 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Prrt1O35449 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Prrt1O35449 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Prrt1O35449 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Prrt1O35449 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Prrt1O35449 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Prrt1O35449 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Prrt1O35449 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Prrt1O35449 Gm37969-201ENSMUST00000195777 3409 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Prrt1O35449 Chek1-202ENSMUST00000172702 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Prrt1O35449 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Prrt1O35449 Tox4-201ENSMUST00000022766 5350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Prrt1O35449 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Prrt1O35449 Foxp1-221ENSMUST00000176632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Prrt1O35449 Foxp1-222ENSMUST00000176850 2339 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Prrt1O35449 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Prrt1O35449 Mical3-217ENSMUST00000207889 9204 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Prrt1O35449 Sparc-202ENSMUST00000108858 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Prrt1O35449 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Prrt1O35449 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Prrt1O35449 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Prrt1O35449 Jam3-201ENSMUST00000034472 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Prrt1O35449 Slc17a5-202ENSMUST00000117645 3114 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Prrt1O35449 Myt1l-201ENSMUST00000021009 5027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Prrt1O35449 Tbc1d17-201ENSMUST00000047085 8750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Prrt1O35449 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Prrt1O35449 Asb8-204ENSMUST00000143400 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Prrt1O35449 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Prrt1O35449 Gm37931-201ENSMUST00000194686 2866 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Prrt1O35449 Mbtps2-203ENSMUST00000112522 3891 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Prrt1O35449 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Prrt1O35449 Ablim2-206ENSMUST00000114206 3528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Prrt1O35449 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Prrt1O35449 Cit-201ENSMUST00000051704 9514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Prrt1O35449 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Prrt1O35449 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Prrt1O35449 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Prrt1O35449 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Prrt1O35449 Robo1-201ENSMUST00000023600 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Prrt1O35449 Gm30648-202ENSMUST00000200648 1957 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Prrt1O35449 Zswim9-203ENSMUST00000119558 3111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Prrt1O35449 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Prrt1O35449 Steap3-203ENSMUST00000112641 5158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Prrt1O35449 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Prrt1O35449 Tmub2-201ENSMUST00000036376 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Prrt1O35449 Zc3h18-205ENSMUST00000176629 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Prrt1O35449 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Prrt1O35449 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Prrt1O35449 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Prrt1O35449 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Prrt1O35449 Gm12316-201ENSMUST00000125853 406 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Prrt1O35449 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Prrt1O35449 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Prrt1O35449 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Prrt1O35449 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Prrt1O35449 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Prrt1O35449 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Prrt1O35449 Slc25a42-202ENSMUST00000110127 3196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Prrt1O35449 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
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