Protein–RNA interactions for Protein: O35261

E2f3, Transcription factor E2F3, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2f3O35261 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
E2f3O35261 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
E2f3O35261 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
E2f3O35261 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
E2f3O35261 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
E2f3O35261 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
E2f3O35261 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
E2f3O35261 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
E2f3O35261 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
E2f3O35261 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
E2f3O35261 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
E2f3O35261 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
E2f3O35261 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
E2f3O35261 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
E2f3O35261 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
E2f3O35261 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
E2f3O35261 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
E2f3O35261 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
E2f3O35261 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
E2f3O35261 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
E2f3O35261 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
E2f3O35261 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
E2f3O35261 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
E2f3O35261 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
E2f3O35261 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
E2f3O35261 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
E2f3O35261 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
E2f3O35261 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
E2f3O35261 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
E2f3O35261 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
E2f3O35261 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
E2f3O35261 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
E2f3O35261 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
E2f3O35261 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
E2f3O35261 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
E2f3O35261 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
E2f3O35261 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
E2f3O35261 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
E2f3O35261 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
E2f3O35261 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
E2f3O35261 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
E2f3O35261 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
E2f3O35261 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
E2f3O35261 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
E2f3O35261 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
E2f3O35261 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
E2f3O35261 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
E2f3O35261 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
E2f3O35261 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
E2f3O35261 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
E2f3O35261 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
E2f3O35261 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
E2f3O35261 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
E2f3O35261 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
E2f3O35261 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
E2f3O35261 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
E2f3O35261 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
E2f3O35261 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
E2f3O35261 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
E2f3O35261 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
E2f3O35261 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
E2f3O35261 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
E2f3O35261 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
E2f3O35261 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
E2f3O35261 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
E2f3O35261 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
E2f3O35261 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
E2f3O35261 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
E2f3O35261 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
E2f3O35261 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
E2f3O35261 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
E2f3O35261 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
E2f3O35261 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
E2f3O35261 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
E2f3O35261 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
E2f3O35261 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
E2f3O35261 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
E2f3O35261 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
E2f3O35261 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
E2f3O35261 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
E2f3O35261 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
E2f3O35261 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
E2f3O35261 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
E2f3O35261 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
E2f3O35261 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
E2f3O35261 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
E2f3O35261 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
E2f3O35261 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
E2f3O35261 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
E2f3O35261 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
E2f3O35261 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
E2f3O35261 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
E2f3O35261 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
E2f3O35261 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
E2f3O35261 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
E2f3O35261 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
E2f3O35261 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
E2f3O35261 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
E2f3O35261 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
E2f3O35261 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms