Protein–RNA interactions for Protein: O08992

Sdcbp, Syntenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SdcbpO08992 Pcgf3-201ENSMUST00000046975 7708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SdcbpO08992 Armcx4-201ENSMUST00000124226 7996 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
SdcbpO08992 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
SdcbpO08992 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SdcbpO08992 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
SdcbpO08992 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
SdcbpO08992 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
SdcbpO08992 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SdcbpO08992 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SdcbpO08992 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
SdcbpO08992 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
SdcbpO08992 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
SdcbpO08992 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SdcbpO08992 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
SdcbpO08992 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SdcbpO08992 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
SdcbpO08992 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SdcbpO08992 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
SdcbpO08992 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
SdcbpO08992 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
SdcbpO08992 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SdcbpO08992 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
SdcbpO08992 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
SdcbpO08992 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SdcbpO08992 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
SdcbpO08992 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SdcbpO08992 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
SdcbpO08992 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SdcbpO08992 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SdcbpO08992 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SdcbpO08992 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
SdcbpO08992 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SdcbpO08992 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
SdcbpO08992 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SdcbpO08992 Hs6st2-201ENSMUST00000088172 4318 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SdcbpO08992 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SdcbpO08992 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SdcbpO08992 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SdcbpO08992 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SdcbpO08992 Ank3-205ENSMUST00000092433 5072 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SdcbpO08992 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SdcbpO08992 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SdcbpO08992 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SdcbpO08992 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SdcbpO08992 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
SdcbpO08992 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SdcbpO08992 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
SdcbpO08992 Cad-211ENSMUST00000202795 6559 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SdcbpO08992 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
SdcbpO08992 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
SdcbpO08992 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SdcbpO08992 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
SdcbpO08992 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
SdcbpO08992 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SdcbpO08992 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SdcbpO08992 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SdcbpO08992 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SdcbpO08992 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SdcbpO08992 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SdcbpO08992 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SdcbpO08992 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SdcbpO08992 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SdcbpO08992 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
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SdcbpO08992 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SdcbpO08992 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
SdcbpO08992 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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SdcbpO08992 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
SdcbpO08992 Tro-202ENSMUST00000087258 6559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SdcbpO08992 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SdcbpO08992 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SdcbpO08992 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SdcbpO08992 Aak1-201ENSMUST00000003710 7203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
SdcbpO08992 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SdcbpO08992 Slc6a2-202ENSMUST00000165470 6007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SdcbpO08992 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SdcbpO08992 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SdcbpO08992 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SdcbpO08992 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SdcbpO08992 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SdcbpO08992 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SdcbpO08992 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SdcbpO08992 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
SdcbpO08992 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
SdcbpO08992 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
SdcbpO08992 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
SdcbpO08992 Zfp46-201ENSMUST00000069195 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
SdcbpO08992 Madd-207ENSMUST00000111369 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
SdcbpO08992 Zmiz1-208ENSMUST00000162645 7482 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
SdcbpO08992 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
SdcbpO08992 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
SdcbpO08992 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
SdcbpO08992 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 129.1 ms