Protein–RNA interactions for Protein: J3QNF7

Gm17577, Predicted gene, 17467, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17577J3QNF7 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Gm17577J3QNF7 Zfp629-203ENSMUST00000122066 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Gm17577J3QNF7 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Gm17577J3QNF7 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
Gm17577J3QNF7 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Gm17577J3QNF7 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
Gm17577J3QNF7 Spen-202ENSMUST00000105786 12299 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
Gm17577J3QNF7 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Gm17577J3QNF7 Grin1-208ENSMUST00000114318 3920 ntTSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
Gm17577J3QNF7 Col6a3-201ENSMUST00000056925 10106 ntTSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
Gm17577J3QNF7 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Gm17577J3QNF7 Pcdhgb8-201ENSMUST00000195764 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Gm17577J3QNF7 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
Gm17577J3QNF7 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Gm17577J3QNF7 Dscaml1-201ENSMUST00000034592 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Gm17577J3QNF7 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Gm17577J3QNF7 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
Gm17577J3QNF7 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Gm17577J3QNF7 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
Gm17577J3QNF7 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC8□□□□□ -1.13
Gm17577J3QNF7 Ankrd26-201ENSMUST00000112830 6930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
Gm17577J3QNF7 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Gm17577J3QNF7 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Gm17577J3QNF7 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Gm17577J3QNF7 Edaradd-201ENSMUST00000179308 6668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Gm17577J3QNF7 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Gm17577J3QNF7 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Gm17577J3QNF7 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Gm17577J3QNF7 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Gm17577J3QNF7 Zdbf2-201ENSMUST00000029025 12112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Gm17577J3QNF7 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Gm17577J3QNF7 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Gm17577J3QNF7 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Gm17577J3QNF7 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Gm17577J3QNF7 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Gm17577J3QNF7 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Gm17577J3QNF7 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Gm17577J3QNF7 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Gm17577J3QNF7 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Gm17577J3QNF7 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Gm17577J3QNF7 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Gm17577J3QNF7 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Gm17577J3QNF7 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Gm17577J3QNF7 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Gm17577J3QNF7 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Gm17577J3QNF7 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Gm17577J3QNF7 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Gm17577J3QNF7 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Gm17577J3QNF7 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Gm17577J3QNF7 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Gm17577J3QNF7 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Gm17577J3QNF7 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Gm17577J3QNF7 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Gm17577J3QNF7 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Gm17577J3QNF7 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Gm17577J3QNF7 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Gm17577J3QNF7 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Gm17577J3QNF7 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Gm17577J3QNF7 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Gm17577J3QNF7 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Gm17577J3QNF7 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Gm17577J3QNF7 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Gm17577J3QNF7 Supt16-201ENSMUST00000046709 4673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Gm17577J3QNF7 Gtf2i-224ENSMUST00000174772 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Gm17577J3QNF7 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Gm17577J3QNF7 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Gm17577J3QNF7 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Gm17577J3QNF7 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Gm17577J3QNF7 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Gm17577J3QNF7 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Gm17577J3QNF7 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Gm17577J3QNF7 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Gm17577J3QNF7 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Gm17577J3QNF7 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Gm17577J3QNF7 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Gm17577J3QNF7 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Gm17577J3QNF7 Pcdhga7-201ENSMUST00000192511 4730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Gm17577J3QNF7 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Gm17577J3QNF7 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Gm17577J3QNF7 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Gm17577J3QNF7 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Gm17577J3QNF7 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Gm17577J3QNF7 Rin1-201ENSMUST00000025818 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Gm17577J3QNF7 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Gm17577J3QNF7 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Gm17577J3QNF7 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Gm17577J3QNF7 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Gm17577J3QNF7 Mb21d1-202ENSMUST00000070742 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Gm17577J3QNF7 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Gm17577J3QNF7 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Gm17577J3QNF7 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Gm17577J3QNF7 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Gm17577J3QNF7 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Gm17577J3QNF7 Ap1b1-203ENSMUST00000109897 3942 ntTSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Gm17577J3QNF7 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Gm17577J3QNF7 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Gm17577J3QNF7 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Gm17577J3QNF7 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Gm17577J3QNF7 Zbtb21-203ENSMUST00000113734 6010 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Gm17577J3QNF7 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.4 ms