Protein–RNA interactions for Protein: J3QJW5

Cldn34c3, Claudin 34C3, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c3J3QJW5 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
Cldn34c3J3QJW5 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
Cldn34c3J3QJW5 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Cldn34c3J3QJW5 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Cldn34c3J3QJW5 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Cldn34c3J3QJW5 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Cldn34c3J3QJW5 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Cldn34c3J3QJW5 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Cldn34c3J3QJW5 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Cldn34c3J3QJW5 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Cldn34c3J3QJW5 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Cldn34c3J3QJW5 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Cldn34c3J3QJW5 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Cldn34c3J3QJW5 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Cldn34c3J3QJW5 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Cldn34c3J3QJW5 Myocd-203ENSMUST00000108695 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Cldn34c3J3QJW5 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Cldn34c3J3QJW5 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Cldn34c3J3QJW5 Tgoln1-201ENSMUST00000070524 5013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Cldn34c3J3QJW5 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Cldn34c3J3QJW5 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Cldn34c3J3QJW5 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Cldn34c3J3QJW5 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Cldn34c3J3QJW5 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Cldn34c3J3QJW5 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Cldn34c3J3QJW5 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Cldn34c3J3QJW5 Ghsr-201ENSMUST00000057186 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Cldn34c3J3QJW5 Tnc-203ENSMUST00000107372 7106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Cldn34c3J3QJW5 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Cldn34c3J3QJW5 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Cldn34c3J3QJW5 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Cldn34c3J3QJW5 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Cldn34c3J3QJW5 Ciita-201ENSMUST00000023147 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Cldn34c3J3QJW5 Brd3-201ENSMUST00000028282 5419 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Cldn34c3J3QJW5 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Cldn34c3J3QJW5 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Cldn34c3J3QJW5 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Cldn34c3J3QJW5 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Cldn34c3J3QJW5 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Cldn34c3J3QJW5 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Cldn34c3J3QJW5 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Cldn34c3J3QJW5 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Cldn34c3J3QJW5 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Cldn34c3J3QJW5 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Cldn34c3J3QJW5 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Cldn34c3J3QJW5 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Cldn34c3J3QJW5 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Cldn34c3J3QJW5 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Cldn34c3J3QJW5 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Cldn34c3J3QJW5 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Cldn34c3J3QJW5 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Cldn34c3J3QJW5 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Cldn34c3J3QJW5 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Cldn34c3J3QJW5 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Cldn34c3J3QJW5 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Cldn34c3J3QJW5 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Cldn34c3J3QJW5 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Cldn34c3J3QJW5 Cep250-202ENSMUST00000094421 7919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Cldn34c3J3QJW5 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Cldn34c3J3QJW5 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Cldn34c3J3QJW5 Slc36a4-201ENSMUST00000061568 6539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Cldn34c3J3QJW5 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Cldn34c3J3QJW5 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Cldn34c3J3QJW5 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC9.65□□□□□ -0.87
Cldn34c3J3QJW5 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Cldn34c3J3QJW5 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Cldn34c3J3QJW5 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Cldn34c3J3QJW5 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Cldn34c3J3QJW5 Bms1-201ENSMUST00000032237 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Cldn34c3J3QJW5 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Cldn34c3J3QJW5 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.87
Cldn34c3J3QJW5 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cldn34c3J3QJW5 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cldn34c3J3QJW5 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cldn34c3J3QJW5 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cldn34c3J3QJW5 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cldn34c3J3QJW5 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cldn34c3J3QJW5 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cldn34c3J3QJW5 Vcan-202ENSMUST00000109544 5702 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cldn34c3J3QJW5 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cldn34c3J3QJW5 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cldn34c3J3QJW5 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Cldn34c3J3QJW5 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cldn34c3J3QJW5 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cldn34c3J3QJW5 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Cldn34c3J3QJW5 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cldn34c3J3QJW5 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cldn34c3J3QJW5 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cldn34c3J3QJW5 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cldn34c3J3QJW5 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cldn34c3J3QJW5 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cldn34c3J3QJW5 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Cldn34c3J3QJW5 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Cldn34c3J3QJW5 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cldn34c3J3QJW5 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Cldn34c3J3QJW5 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Cldn34c3J3QJW5 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Cldn34c3J3QJW5 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cldn34c3J3QJW5 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cldn34c3J3QJW5 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
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