Protein–RNA interactions for Protein: H3BJN7

Gm20696, Predicted gene 20696, mousemouse

Predictions only

Length 74 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20696H3BJN7 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm20696H3BJN7 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm20696H3BJN7 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm20696H3BJN7 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm20696H3BJN7 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm20696H3BJN7 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm20696H3BJN7 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm20696H3BJN7 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm20696H3BJN7 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm20696H3BJN7 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm20696H3BJN7 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm20696H3BJN7 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm20696H3BJN7 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm20696H3BJN7 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm20696H3BJN7 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm20696H3BJN7 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm20696H3BJN7 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm20696H3BJN7 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm20696H3BJN7 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm20696H3BJN7 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm20696H3BJN7 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm20696H3BJN7 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm20696H3BJN7 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm20696H3BJN7 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm20696H3BJN7 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm20696H3BJN7 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm20696H3BJN7 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm20696H3BJN7 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm20696H3BJN7 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm20696H3BJN7 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm20696H3BJN7 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm20696H3BJN7 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm20696H3BJN7 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm20696H3BJN7 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm20696H3BJN7 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm20696H3BJN7 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm20696H3BJN7 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm20696H3BJN7 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm20696H3BJN7 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm20696H3BJN7 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm20696H3BJN7 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm20696H3BJN7 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm20696H3BJN7 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm20696H3BJN7 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm20696H3BJN7 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm20696H3BJN7 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm20696H3BJN7 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm20696H3BJN7 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm20696H3BJN7 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm20696H3BJN7 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm20696H3BJN7 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm20696H3BJN7 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm20696H3BJN7 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm20696H3BJN7 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm20696H3BJN7 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gm20696H3BJN7 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gm20696H3BJN7 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gm20696H3BJN7 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gm20696H3BJN7 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gm20696H3BJN7 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gm20696H3BJN7 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gm20696H3BJN7 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gm20696H3BJN7 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gm20696H3BJN7 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gm20696H3BJN7 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gm20696H3BJN7 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gm20696H3BJN7 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm20696H3BJN7 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm20696H3BJN7 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm20696H3BJN7 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm20696H3BJN7 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm20696H3BJN7 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm20696H3BJN7 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm20696H3BJN7 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm20696H3BJN7 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm20696H3BJN7 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm20696H3BJN7 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm20696H3BJN7 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm20696H3BJN7 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm20696H3BJN7 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm20696H3BJN7 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm20696H3BJN7 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm20696H3BJN7 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm20696H3BJN7 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm20696H3BJN7 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm20696H3BJN7 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm20696H3BJN7 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm20696H3BJN7 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm20696H3BJN7 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm20696H3BJN7 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm20696H3BJN7 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm20696H3BJN7 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm20696H3BJN7 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm20696H3BJN7 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm20696H3BJN7 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm20696H3BJN7 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm20696H3BJN7 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm20696H3BJN7 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm20696H3BJN7 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm20696H3BJN7 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.6 ms