Protein–RNA interactions for Protein: G3UW87

Gm17455, MCG55969, mousemouse

Predictions only

Length 128 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17455G3UW87 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm17455G3UW87 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm17455G3UW87 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm17455G3UW87 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm17455G3UW87 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm17455G3UW87 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm17455G3UW87 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm17455G3UW87 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm17455G3UW87 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm17455G3UW87 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm17455G3UW87 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm17455G3UW87 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm17455G3UW87 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm17455G3UW87 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm17455G3UW87 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm17455G3UW87 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm17455G3UW87 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm17455G3UW87 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm17455G3UW87 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm17455G3UW87 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm17455G3UW87 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm17455G3UW87 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm17455G3UW87 Gm14193-201ENSMUST00000105067 153 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm17455G3UW87 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm17455G3UW87 Gm15573-201ENSMUST00000119487 540 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm17455G3UW87 Gm14585-201ENSMUST00000120713 634 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm17455G3UW87 Gm12208-201ENSMUST00000122004 163 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm17455G3UW87 Gm14965-201ENSMUST00000124118 565 ntTSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm17455G3UW87 Aamdc-213ENSMUST00000154853 883 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm17455G3UW87 Gm23045-201ENSMUST00000175041 96 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm17455G3UW87 Slc2a4rg-ps-202ENSMUST00000176590 1143 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm17455G3UW87 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm17455G3UW87 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm17455G3UW87 8030442B05Rik-201ENSMUST00000192626 1035 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm17455G3UW87 Gm44270-201ENSMUST00000203084 1234 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm17455G3UW87 Gm35549-201ENSMUST00000203176 735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm17455G3UW87 Gm8285-201ENSMUST00000208293 759 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm17455G3UW87 CT485607.1-201ENSMUST00000216100 85 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm17455G3UW87 Ddo-207ENSMUST00000216830 806 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm17455G3UW87 Hist1h1b-201ENSMUST00000080511 743 ntAPPRIS P1 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm17455G3UW87 Tepp-201ENSMUST00000098480 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm17455G3UW87 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm17455G3UW87 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm17455G3UW87 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm17455G3UW87 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.65□□□□□ -0.86
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Gm17455G3UW87 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Gm17455G3UW87 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Gm17455G3UW87 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Gm17455G3UW87 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Gm17455G3UW87 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.87
Gm17455G3UW87 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Gm17455G3UW87 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Gm17455G3UW87 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Gm17455G3UW87 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.87
Gm17455G3UW87 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
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Gm17455G3UW87 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Gm17455G3UW87 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC9.65□□□□□ -0.87
Gm17455G3UW87 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
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Gm17455G3UW87 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm17455G3UW87 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
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Gm17455G3UW87 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm17455G3UW87 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
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Gm17455G3UW87 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm17455G3UW87 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm17455G3UW87 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm17455G3UW87 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm17455G3UW87 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm17455G3UW87 Gm21998-201ENSMUST00000117552 1308 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm17455G3UW87 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm17455G3UW87 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm17455G3UW87 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm17455G3UW87 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm17455G3UW87 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm17455G3UW87 Gm22920-201ENSMUST00000102175 109 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm17455G3UW87 Gm12579-201ENSMUST00000118040 783 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm17455G3UW87 Gm4726-201ENSMUST00000135604 736 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm17455G3UW87 Gm11831-201ENSMUST00000141538 629 ntTSL 3 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm17455G3UW87 Gm6019-201ENSMUST00000148369 736 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm17455G3UW87 Ccser2-208ENSMUST00000183007 1293 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm17455G3UW87 Mir7032-201ENSMUST00000185154 79 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm17455G3UW87 1700029J03Rik-201ENSMUST00000185803 789 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm17455G3UW87 Gm5852-201ENSMUST00000194119 1021 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm17455G3UW87 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm17455G3UW87 Pgpep1l-202ENSMUST00000207874 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm17455G3UW87 Gm6108-201ENSMUST00000208365 367 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm17455G3UW87 4930448E22Rik-203ENSMUST00000215349 299 ntTSL 3 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm17455G3UW87 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm17455G3UW87 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm17455G3UW87 Gm18974-201ENSMUST00000221478 1031 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm17455G3UW87 AC134869.3-201ENSMUST00000225581 343 ntAPPRIS P1 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm17455G3UW87 AC171241.1-201ENSMUST00000228144 1166 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm17455G3UW87 Tff1-201ENSMUST00000024831 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm17455G3UW87 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.1 ms