Protein–RNA interactions for Protein: D3YXE9

BC048679, cDNA sequence BC048679, mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC048679D3YXE9 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
BC048679D3YXE9 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
BC048679D3YXE9 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
BC048679D3YXE9 Megf11-203ENSMUST00000118485 3944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
BC048679D3YXE9 Eef2k-203ENSMUST00000106488 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
BC048679D3YXE9 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
BC048679D3YXE9 Arhgef4-204ENSMUST00000159747 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
BC048679D3YXE9 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
BC048679D3YXE9 Nol6-201ENSMUST00000030138 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
BC048679D3YXE9 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
BC048679D3YXE9 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
BC048679D3YXE9 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
BC048679D3YXE9 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
BC048679D3YXE9 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
BC048679D3YXE9 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
BC048679D3YXE9 Tmprss6-201ENSMUST00000017086 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
BC048679D3YXE9 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
BC048679D3YXE9 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
BC048679D3YXE9 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
BC048679D3YXE9 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
BC048679D3YXE9 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
BC048679D3YXE9 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
BC048679D3YXE9 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
BC048679D3YXE9 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
BC048679D3YXE9 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
BC048679D3YXE9 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
BC048679D3YXE9 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
BC048679D3YXE9 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
BC048679D3YXE9 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
BC048679D3YXE9 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
BC048679D3YXE9 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
BC048679D3YXE9 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
BC048679D3YXE9 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
BC048679D3YXE9 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
BC048679D3YXE9 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
BC048679D3YXE9 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
BC048679D3YXE9 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
BC048679D3YXE9 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
BC048679D3YXE9 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
BC048679D3YXE9 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
BC048679D3YXE9 Tnc-203ENSMUST00000107372 7106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
BC048679D3YXE9 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
BC048679D3YXE9 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
BC048679D3YXE9 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
BC048679D3YXE9 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
BC048679D3YXE9 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
BC048679D3YXE9 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
BC048679D3YXE9 Polr3e-201ENSMUST00000033173 4194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
BC048679D3YXE9 Pyurf-201ENSMUST00000053386 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
BC048679D3YXE9 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
BC048679D3YXE9 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
BC048679D3YXE9 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
BC048679D3YXE9 Manea-201ENSMUST00000041374 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
BC048679D3YXE9 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
BC048679D3YXE9 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
BC048679D3YXE9 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
BC048679D3YXE9 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
BC048679D3YXE9 Inpp4a-203ENSMUST00000114933 3004 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
BC048679D3YXE9 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
BC048679D3YXE9 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
BC048679D3YXE9 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
BC048679D3YXE9 Bub3-203ENSMUST00000207442 3414 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
BC048679D3YXE9 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
BC048679D3YXE9 Gm45234-201ENSMUST00000129411 4359 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
BC048679D3YXE9 Eif3a-201ENSMUST00000025955 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
BC048679D3YXE9 Cc2d1a-201ENSMUST00000040383 3471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
BC048679D3YXE9 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
BC048679D3YXE9 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
BC048679D3YXE9 Bcl9l-203ENSMUST00000218183 6771 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
BC048679D3YXE9 Gm42372-201ENSMUST00000206129 5067 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
BC048679D3YXE9 Adra2b-202ENSMUST00000104934 4014 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
BC048679D3YXE9 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
BC048679D3YXE9 Cad-211ENSMUST00000202795 6559 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
BC048679D3YXE9 Plekha6-204ENSMUST00000187285 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
BC048679D3YXE9 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
BC048679D3YXE9 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
BC048679D3YXE9 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
BC048679D3YXE9 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
BC048679D3YXE9 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
BC048679D3YXE9 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
BC048679D3YXE9 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
BC048679D3YXE9 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
BC048679D3YXE9 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
BC048679D3YXE9 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
BC048679D3YXE9 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
BC048679D3YXE9 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
BC048679D3YXE9 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
BC048679D3YXE9 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
BC048679D3YXE9 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
BC048679D3YXE9 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
BC048679D3YXE9 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
BC048679D3YXE9 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
BC048679D3YXE9 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
BC048679D3YXE9 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
BC048679D3YXE9 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
BC048679D3YXE9 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
BC048679D3YXE9 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
BC048679D3YXE9 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
BC048679D3YXE9 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
BC048679D3YXE9 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms