Protein–RNA interactions for Protein: B1B213

H60c, Histocompatibility antigen 60c, mousemouse

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Length 197 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H60cB1B213 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
H60cB1B213 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
H60cB1B213 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
H60cB1B213 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
H60cB1B213 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
H60cB1B213 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
H60cB1B213 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
H60cB1B213 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
H60cB1B213 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
H60cB1B213 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
H60cB1B213 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
H60cB1B213 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
H60cB1B213 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
H60cB1B213 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
H60cB1B213 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
H60cB1B213 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
H60cB1B213 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
H60cB1B213 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
H60cB1B213 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
H60cB1B213 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
H60cB1B213 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
H60cB1B213 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
H60cB1B213 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
H60cB1B213 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
H60cB1B213 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
H60cB1B213 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
H60cB1B213 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
H60cB1B213 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
H60cB1B213 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
H60cB1B213 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
H60cB1B213 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
H60cB1B213 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
H60cB1B213 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
H60cB1B213 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
H60cB1B213 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
H60cB1B213 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
H60cB1B213 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
H60cB1B213 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
H60cB1B213 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
H60cB1B213 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
H60cB1B213 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
H60cB1B213 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
H60cB1B213 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
H60cB1B213 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
H60cB1B213 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
H60cB1B213 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
H60cB1B213 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
H60cB1B213 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
H60cB1B213 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
H60cB1B213 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
H60cB1B213 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
H60cB1B213 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
H60cB1B213 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
H60cB1B213 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
H60cB1B213 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
H60cB1B213 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
H60cB1B213 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
H60cB1B213 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
H60cB1B213 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
H60cB1B213 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
H60cB1B213 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
H60cB1B213 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
H60cB1B213 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
H60cB1B213 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
H60cB1B213 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
H60cB1B213 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
H60cB1B213 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
H60cB1B213 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
H60cB1B213 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
H60cB1B213 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
H60cB1B213 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
H60cB1B213 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
H60cB1B213 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
H60cB1B213 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
H60cB1B213 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
H60cB1B213 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
H60cB1B213 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
H60cB1B213 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
H60cB1B213 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
H60cB1B213 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
H60cB1B213 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
H60cB1B213 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
H60cB1B213 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
H60cB1B213 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
H60cB1B213 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
H60cB1B213 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
H60cB1B213 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
H60cB1B213 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
H60cB1B213 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
H60cB1B213 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
H60cB1B213 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
H60cB1B213 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
H60cB1B213 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
H60cB1B213 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
H60cB1B213 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
H60cB1B213 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
H60cB1B213 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
H60cB1B213 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
H60cB1B213 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
H60cB1B213 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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