Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ25

Skt, Sickle tail protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,946 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SktA2AQ25 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SktA2AQ25 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SktA2AQ25 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SktA2AQ25 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SktA2AQ25 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SktA2AQ25 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
SktA2AQ25 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
SktA2AQ25 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SktA2AQ25 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SktA2AQ25 Gm21358-201ENSMUST00000191645 1659 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
SktA2AQ25 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SktA2AQ25 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SktA2AQ25 Snai2-201ENSMUST00000023356 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SktA2AQ25 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
SktA2AQ25 4930502E09Rik-201ENSMUST00000126016 755 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SktA2AQ25 Bach2it1-201ENSMUST00000133451 481 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SktA2AQ25 Utp23-202ENSMUST00000136129 779 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SktA2AQ25 Gm20400-201ENSMUST00000173695 665 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SktA2AQ25 Gm10807-201ENSMUST00000177134 795 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
SktA2AQ25 Dydc1-203ENSMUST00000189865 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SktA2AQ25 Gm35025-203ENSMUST00000193519 634 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SktA2AQ25 Gm8436-201ENSMUST00000210152 1080 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
SktA2AQ25 Gm5749-201ENSMUST00000210673 1090 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
SktA2AQ25 Gm30671-201ENSMUST00000214898 318 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
SktA2AQ25 AC154826.1-201ENSMUST00000217369 498 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SktA2AQ25 AC122346.3-201ENSMUST00000223983 306 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
SktA2AQ25 C8g-202ENSMUST00000040042 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SktA2AQ25 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SktA2AQ25 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SktA2AQ25 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SktA2AQ25 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SktA2AQ25 4930555B11Rik-201ENSMUST00000123210 1533 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SktA2AQ25 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SktA2AQ25 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SktA2AQ25 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SktA2AQ25 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
SktA2AQ25 Ypel4-201ENSMUST00000090729 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SktA2AQ25 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SktA2AQ25 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SktA2AQ25 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SktA2AQ25 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SktA2AQ25 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SktA2AQ25 Ccdc90b-202ENSMUST00000085017 1494 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SktA2AQ25 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SktA2AQ25 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SktA2AQ25 Slc38a5-203ENSMUST00000115591 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SktA2AQ25 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SktA2AQ25 0610010K14Rik-206ENSMUST00000108576 576 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SktA2AQ25 Gm13019-201ENSMUST00000120000 276 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
SktA2AQ25 Gm17192-201ENSMUST00000169031 511 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
SktA2AQ25 Gm9507-202ENSMUST00000180157 654 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
SktA2AQ25 Gm18499-201ENSMUST00000220808 1021 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
SktA2AQ25 Mitd1-201ENSMUST00000027257 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SktA2AQ25 Cxcl1-201ENSMUST00000031327 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SktA2AQ25 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SktA2AQ25 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SktA2AQ25 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SktA2AQ25 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SktA2AQ25 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SktA2AQ25 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SktA2AQ25 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
SktA2AQ25 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SktA2AQ25 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SktA2AQ25 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SktA2AQ25 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SktA2AQ25 Gm2000-201ENSMUST00000102782 445 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SktA2AQ25 Hist1h2bk-201ENSMUST00000110455 476 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SktA2AQ25 Txnrd2-205ENSMUST00000126778 491 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SktA2AQ25 Gm8459-201ENSMUST00000162504 760 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
SktA2AQ25 Tro-208ENSMUST00000164071 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SktA2AQ25 Vmn1r-ps63-201ENSMUST00000174565 989 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
SktA2AQ25 Gm18776-201ENSMUST00000188833 654 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
SktA2AQ25 Nmbr-206ENSMUST00000190114 662 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SktA2AQ25 Gm9884-201ENSMUST00000194343 1222 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
SktA2AQ25 Isoc2b-205ENSMUST00000208816 820 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SktA2AQ25 4930543N07Rik-202ENSMUST00000209503 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SktA2AQ25 Gm7940-201ENSMUST00000218195 769 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
SktA2AQ25 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SktA2AQ25 CT009546.1-201ENSMUST00000222573 1120 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
SktA2AQ25 4930449E01Rik-201ENSMUST00000022711 595 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SktA2AQ25 2310057N15Rik-201ENSMUST00000054223 1028 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SktA2AQ25 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SktA2AQ25 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SktA2AQ25 Gm13556-201ENSMUST00000132692 1412 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SktA2AQ25 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SktA2AQ25 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SktA2AQ25 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SktA2AQ25 Enpp5-201ENSMUST00000024756 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SktA2AQ25 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SktA2AQ25 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SktA2AQ25 Ephx1-201ENSMUST00000036928 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SktA2AQ25 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SktA2AQ25 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SktA2AQ25 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SktA2AQ25 4933406C10Rik-201ENSMUST00000180391 1451 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SktA2AQ25 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SktA2AQ25 Capzb-201ENSMUST00000030518 1390 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SktA2AQ25 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SktA2AQ25 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SktA2AQ25 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.3 ms