Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZD4

Ercc4, DNA repair endonuclease XPF, mousemouse

Predictions only

Length 917 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc4Q9QZD4 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ercc4Q9QZD4 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ercc4Q9QZD4 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ercc4Q9QZD4 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ercc4Q9QZD4 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ercc4Q9QZD4 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ercc4Q9QZD4 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ercc4Q9QZD4 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ercc4Q9QZD4 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ercc4Q9QZD4 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ercc4Q9QZD4 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ercc4Q9QZD4 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ercc4Q9QZD4 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ercc4Q9QZD4 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ercc4Q9QZD4 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ercc4Q9QZD4 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ercc4Q9QZD4 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ercc4Q9QZD4 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ercc4Q9QZD4 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ercc4Q9QZD4 Wdr75-201ENSMUST00000027139 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ercc4Q9QZD4 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ercc4Q9QZD4 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ercc4Q9QZD4 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Ercc4Q9QZD4 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ercc4Q9QZD4 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ercc4Q9QZD4 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ercc4Q9QZD4 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ercc4Q9QZD4 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ercc4Q9QZD4 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Ercc4Q9QZD4 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ercc4Q9QZD4 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ercc4Q9QZD4 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Ercc4Q9QZD4 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Ercc4Q9QZD4 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ercc4Q9QZD4 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ercc4Q9QZD4 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ercc4Q9QZD4 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Ercc4Q9QZD4 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ercc4Q9QZD4 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ercc4Q9QZD4 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ercc4Q9QZD4 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ercc4Q9QZD4 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ercc4Q9QZD4 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ercc4Q9QZD4 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ercc4Q9QZD4 Ints6l-207ENSMUST00000186445 3608 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ercc4Q9QZD4 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ercc4Q9QZD4 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ercc4Q9QZD4 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ercc4Q9QZD4 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ercc4Q9QZD4 Erich3-203ENSMUST00000189969 3460 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Ercc4Q9QZD4 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ercc4Q9QZD4 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Ercc4Q9QZD4 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ercc4Q9QZD4 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
Ercc4Q9QZD4 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ercc4Q9QZD4 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ercc4Q9QZD4 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ercc4Q9QZD4 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ercc4Q9QZD4 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
Ercc4Q9QZD4 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ercc4Q9QZD4 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ercc4Q9QZD4 Pmaip1-201ENSMUST00000025399 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ercc4Q9QZD4 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ercc4Q9QZD4 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ercc4Q9QZD4 Gm20696-201ENSMUST00000155466 3560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ercc4Q9QZD4 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ercc4Q9QZD4 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ercc4Q9QZD4 B3glct-201ENSMUST00000100404 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ercc4Q9QZD4 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ercc4Q9QZD4 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ercc4Q9QZD4 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ercc4Q9QZD4 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ercc4Q9QZD4 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ercc4Q9QZD4 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ercc4Q9QZD4 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ercc4Q9QZD4 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Ercc4Q9QZD4 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Ercc4Q9QZD4 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Ercc4Q9QZD4 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ercc4Q9QZD4 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ercc4Q9QZD4 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ercc4Q9QZD4 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ercc4Q9QZD4 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ercc4Q9QZD4 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ercc4Q9QZD4 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ercc4Q9QZD4 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ercc4Q9QZD4 Wdr43-201ENSMUST00000047086 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ercc4Q9QZD4 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ercc4Q9QZD4 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ercc4Q9QZD4 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ercc4Q9QZD4 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ercc4Q9QZD4 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ercc4Q9QZD4 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ercc4Q9QZD4 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ercc4Q9QZD4 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ercc4Q9QZD4 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ercc4Q9QZD4 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ercc4Q9QZD4 Wnt7b-203ENSMUST00000167968 3408 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ercc4Q9QZD4 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ercc4Q9QZD4 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms