Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXW4

Fscn3, Fascin-3, mousemouse

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Length 498 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fscn3Q9QXW4 Gm5523-201ENSMUST00000180415 997 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
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Fscn3Q9QXW4 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Fscn3Q9QXW4 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Fscn3Q9QXW4 AC154276.3-201ENSMUST00000227643 998 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
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Fscn3Q9QXW4 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Fscn3Q9QXW4 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Fscn3Q9QXW4 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Fscn3Q9QXW4 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Fscn3Q9QXW4 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Fscn3Q9QXW4 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Fscn3Q9QXW4 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Fscn3Q9QXW4 Gm43081-201ENSMUST00000199082 1380 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Fscn3Q9QXW4 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Fscn3Q9QXW4 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Fscn3Q9QXW4 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Fscn3Q9QXW4 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Fscn3Q9QXW4 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Fscn3Q9QXW4 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Fscn3Q9QXW4 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Fscn3Q9QXW4 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Fscn3Q9QXW4 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Fscn3Q9QXW4 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Fscn3Q9QXW4 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Fscn3Q9QXW4 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Fscn3Q9QXW4 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Fscn3Q9QXW4 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Fscn3Q9QXW4 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Fscn3Q9QXW4 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
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Fscn3Q9QXW4 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
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Fscn3Q9QXW4 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
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Fscn3Q9QXW4 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
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Fscn3Q9QXW4 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
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Fscn3Q9QXW4 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Fscn3Q9QXW4 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Fscn3Q9QXW4 Mbtps2-203ENSMUST00000112522 3891 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Fscn3Q9QXW4 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Fscn3Q9QXW4 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Fscn3Q9QXW4 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Fscn3Q9QXW4 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Fscn3Q9QXW4 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Fscn3Q9QXW4 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Fscn3Q9QXW4 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Fscn3Q9QXW4 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Fscn3Q9QXW4 Maml2-202ENSMUST00000159294 6404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Fscn3Q9QXW4 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Fscn3Q9QXW4 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58 ms