Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC33

Hmg20a, High mobility group protein 20A, mousemouse

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Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmg20aQ9DC33 Fkbp15-204ENSMUST00000107461 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hmg20aQ9DC33 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hmg20aQ9DC33 Pou6f1-201ENSMUST00000058274 2523 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hmg20aQ9DC33 Synj2-203ENSMUST00000115784 2634 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hmg20aQ9DC33 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hmg20aQ9DC33 Tgoln1-201ENSMUST00000070524 5013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hmg20aQ9DC33 Hars2-206ENSMUST00000152954 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hmg20aQ9DC33 Ppargc1b-201ENSMUST00000063307 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hmg20aQ9DC33 Kbtbd12-206ENSMUST00000184878 3351 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hmg20aQ9DC33 Zfp217-202ENSMUST00000109155 5670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hmg20aQ9DC33 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hmg20aQ9DC33 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hmg20aQ9DC33 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hmg20aQ9DC33 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Hmg20aQ9DC33 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hmg20aQ9DC33 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hmg20aQ9DC33 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Hmg20aQ9DC33 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Hmg20aQ9DC33 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hmg20aQ9DC33 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hmg20aQ9DC33 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hmg20aQ9DC33 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hmg20aQ9DC33 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Hmg20aQ9DC33 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hmg20aQ9DC33 Vwa5b2-207ENSMUST00000159780 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hmg20aQ9DC33 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hmg20aQ9DC33 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Hmg20aQ9DC33 Fbln2-202ENSMUST00000113498 4644 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hmg20aQ9DC33 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hmg20aQ9DC33 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hmg20aQ9DC33 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hmg20aQ9DC33 Igtp-203ENSMUST00000168280 1832 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hmg20aQ9DC33 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Hmg20aQ9DC33 Ift88os-201ENSMUST00000149702 2016 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hmg20aQ9DC33 Serpinf2-201ENSMUST00000043696 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hmg20aQ9DC33 Scn8a-203ENSMUST00000108908 7030 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hmg20aQ9DC33 Col6a6-203ENSMUST00000166431 7098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hmg20aQ9DC33 Sass6-204ENSMUST00000197335 2458 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hmg20aQ9DC33 Nckap5-212ENSMUST00000162877 2630 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hmg20aQ9DC33 Dync1i2-201ENSMUST00000081710 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hmg20aQ9DC33 L3mbtl1-201ENSMUST00000035751 2724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hmg20aQ9DC33 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hmg20aQ9DC33 Acox3-203ENSMUST00000114237 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hmg20aQ9DC33 Fut8-203ENSMUST00000177595 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hmg20aQ9DC33 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Hmg20aQ9DC33 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hmg20aQ9DC33 Kif19a-201ENSMUST00000084368 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hmg20aQ9DC33 Gpc6-202ENSMUST00000088483 3488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hmg20aQ9DC33 Zbtb21-203ENSMUST00000113734 6010 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hmg20aQ9DC33 Dscaml1-201ENSMUST00000034592 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hmg20aQ9DC33 Madd-213ENSMUST00000111376 5927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hmg20aQ9DC33 Ptpn23-201ENSMUST00000040021 5346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hmg20aQ9DC33 Pcdha6-201ENSMUST00000193389 4653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hmg20aQ9DC33 Tti2-204ENSMUST00000210129 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hmg20aQ9DC33 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hmg20aQ9DC33 Man2b2-201ENSMUST00000031002 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hmg20aQ9DC33 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hmg20aQ9DC33 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hmg20aQ9DC33 Suclg2-201ENSMUST00000079847 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hmg20aQ9DC33 Araf-201ENSMUST00000001155 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
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Hmg20aQ9DC33 Gcnt7-201ENSMUST00000099060 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hmg20aQ9DC33 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
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Hmg20aQ9DC33 Trim9-202ENSMUST00000110522 4405 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
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Hmg20aQ9DC33 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hmg20aQ9DC33 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Hmg20aQ9DC33 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hmg20aQ9DC33 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Hmg20aQ9DC33 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hmg20aQ9DC33 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hmg20aQ9DC33 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hmg20aQ9DC33 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hmg20aQ9DC33 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hmg20aQ9DC33 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hmg20aQ9DC33 Mon2-201ENSMUST00000037557 5511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Hmg20aQ9DC33 Pom121l2-201ENSMUST00000017126 2960 ntAPPRIS P4 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Hmg20aQ9DC33 Rsph10b-203ENSMUST00000166847 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Hmg20aQ9DC33 Imp4-201ENSMUST00000027303 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Hmg20aQ9DC33 Anxa6-201ENSMUST00000102727 2471 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Hmg20aQ9DC33 Odf2l-204ENSMUST00000106192 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Hmg20aQ9DC33 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Hmg20aQ9DC33 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Hmg20aQ9DC33 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Hmg20aQ9DC33 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Hmg20aQ9DC33 Pck2-201ENSMUST00000048781 3400 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Hmg20aQ9DC33 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Hmg20aQ9DC33 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hmg20aQ9DC33 Gm14005-209ENSMUST00000224993 1832 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Hmg20aQ9DC33 Mpl-202ENSMUST00000102671 2934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hmg20aQ9DC33 Rsc1a1-201ENSMUST00000105782 1749 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hmg20aQ9DC33 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hmg20aQ9DC33 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hmg20aQ9DC33 Pitpnb-204ENSMUST00000200298 2632 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
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