Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU5

Rnf6, E3 ubiquitin-protein ligase RNF6, mousemouse

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Length 667 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf6Q9DBU5 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rnf6Q9DBU5 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rnf6Q9DBU5 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rnf6Q9DBU5 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rnf6Q9DBU5 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Rnf6Q9DBU5 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rnf6Q9DBU5 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Rnf6Q9DBU5 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rnf6Q9DBU5 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rnf6Q9DBU5 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rnf6Q9DBU5 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rnf6Q9DBU5 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Rnf6Q9DBU5 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rnf6Q9DBU5 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rnf6Q9DBU5 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Rnf6Q9DBU5 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Rnf6Q9DBU5 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Rnf6Q9DBU5 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Rnf6Q9DBU5 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Rnf6Q9DBU5 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rnf6Q9DBU5 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Rnf6Q9DBU5 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Rnf6Q9DBU5 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Rnf6Q9DBU5 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Rnf6Q9DBU5 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rnf6Q9DBU5 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Rnf6Q9DBU5 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Rnf6Q9DBU5 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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