Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB90

Smg9, Protein SMG9, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg9Q9DB90 Gm6019-201ENSMUST00000148369 736 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Smg9Q9DB90 4921527H02Rik-201ENSMUST00000196028 246 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Smg9Q9DB90 Mrnip-201ENSMUST00000020647 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Smg9Q9DB90 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Smg9Q9DB90 C330004P14Rik-201ENSMUST00000218833 628 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Smg9Q9DB90 CT010486.3-201ENSMUST00000224555 811 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Smg9Q9DB90 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Smg9Q9DB90 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Smg9Q9DB90 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Smg9Q9DB90 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Smg9Q9DB90 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Smg9Q9DB90 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Smg9Q9DB90 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Smg9Q9DB90 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Smg9Q9DB90 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Smg9Q9DB90 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Smg9Q9DB90 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Smg9Q9DB90 Dubr-204ENSMUST00000186944 2052 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Smg9Q9DB90 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Smg9Q9DB90 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Smg9Q9DB90 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Smg9Q9DB90 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Smg9Q9DB90 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Smg9Q9DB90 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Smg9Q9DB90 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Smg9Q9DB90 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Smg9Q9DB90 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Smg9Q9DB90 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Smg9Q9DB90 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Smg9Q9DB90 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Smg9Q9DB90 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Smg9Q9DB90 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Smg9Q9DB90 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Smg9Q9DB90 Gm29500-201ENSMUST00000185992 1344 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Smg9Q9DB90 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Smg9Q9DB90 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Smg9Q9DB90 Ifitm10-203ENSMUST00000105988 824 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Smg9Q9DB90 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Smg9Q9DB90 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Smg9Q9DB90 Gm22144-201ENSMUST00000157402 102 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Smg9Q9DB90 Ighv1-48-201ENSMUST00000191795 294 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Smg9Q9DB90 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Smg9Q9DB90 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Smg9Q9DB90 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Smg9Q9DB90 4930448E22Rik-203ENSMUST00000215349 299 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Smg9Q9DB90 CT009713.8-202ENSMUST00000224732 385 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Smg9Q9DB90 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Smg9Q9DB90 AC171241.1-201ENSMUST00000228144 1166 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Smg9Q9DB90 Crisp4-201ENSMUST00000026876 1252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Smg9Q9DB90 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Smg9Q9DB90 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Smg9Q9DB90 Actg-ps1-201ENSMUST00000099636 1124 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Smg9Q9DB90 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Smg9Q9DB90 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Smg9Q9DB90 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Smg9Q9DB90 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Smg9Q9DB90 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Smg9Q9DB90 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Smg9Q9DB90 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Smg9Q9DB90 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Smg9Q9DB90 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Smg9Q9DB90 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Smg9Q9DB90 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Smg9Q9DB90 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Smg9Q9DB90 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Smg9Q9DB90 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Smg9Q9DB90 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Smg9Q9DB90 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Smg9Q9DB90 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Smg9Q9DB90 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Smg9Q9DB90 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Smg9Q9DB90 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Smg9Q9DB90 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Smg9Q9DB90 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Smg9Q9DB90 Gm9387-201ENSMUST00000098624 1320 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Smg9Q9DB90 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Smg9Q9DB90 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Smg9Q9DB90 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Smg9Q9DB90 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Smg9Q9DB90 Ighv1-61-201ENSMUST00000103531 351 ntAPPRIS P1 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Smg9Q9DB90 Mapkapk5-203ENSMUST00000111782 969 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Smg9Q9DB90 Apoo-202ENSMUST00000113896 1032 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Smg9Q9DB90 Cav2-202ENSMUST00000115459 974 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Smg9Q9DB90 Tmed5-203ENSMUST00000117759 482 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Smg9Q9DB90 Rdh9-203ENSMUST00000136223 1276 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Smg9Q9DB90 Gm15881-201ENSMUST00000148792 942 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Smg9Q9DB90 Gm11706-201ENSMUST00000151282 316 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Smg9Q9DB90 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Smg9Q9DB90 Gm18974-201ENSMUST00000221478 1031 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Smg9Q9DB90 AC154634.3-201ENSMUST00000224589 736 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Smg9Q9DB90 AC134869.3-201ENSMUST00000225581 343 ntAPPRIS P1 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Smg9Q9DB90 Psmg2-201ENSMUST00000025418 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Smg9Q9DB90 Sstr2-201ENSMUST00000067591 1041 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Smg9Q9DB90 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Smg9Q9DB90 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Smg9Q9DB90 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Smg9Q9DB90 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Smg9Q9DB90 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Smg9Q9DB90 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Smg9Q9DB90 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51 ms