Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8T7

Slirp, SRA stem-loop-interacting RNA-binding protein, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 112 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SlirpQ9D8T7 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SlirpQ9D8T7 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SlirpQ9D8T7 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SlirpQ9D8T7 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SlirpQ9D8T7 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SlirpQ9D8T7 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SlirpQ9D8T7 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SlirpQ9D8T7 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SlirpQ9D8T7 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SlirpQ9D8T7 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
SlirpQ9D8T7 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SlirpQ9D8T7 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SlirpQ9D8T7 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SlirpQ9D8T7 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SlirpQ9D8T7 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SlirpQ9D8T7 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SlirpQ9D8T7 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SlirpQ9D8T7 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SlirpQ9D8T7 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SlirpQ9D8T7 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SlirpQ9D8T7 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SlirpQ9D8T7 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SlirpQ9D8T7 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SlirpQ9D8T7 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SlirpQ9D8T7 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SlirpQ9D8T7 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SlirpQ9D8T7 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SlirpQ9D8T7 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SlirpQ9D8T7 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SlirpQ9D8T7 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
SlirpQ9D8T7 Gm26684-202ENSMUST00000228229 8257 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
SlirpQ9D8T7 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SlirpQ9D8T7 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SlirpQ9D8T7 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SlirpQ9D8T7 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SlirpQ9D8T7 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SlirpQ9D8T7 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SlirpQ9D8T7 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SlirpQ9D8T7 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SlirpQ9D8T7 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SlirpQ9D8T7 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SlirpQ9D8T7 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SlirpQ9D8T7 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SlirpQ9D8T7 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SlirpQ9D8T7 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SlirpQ9D8T7 Cttnbp2nl-201ENSMUST00000077548 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SlirpQ9D8T7 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SlirpQ9D8T7 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SlirpQ9D8T7 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SlirpQ9D8T7 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SlirpQ9D8T7 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
SlirpQ9D8T7 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
SlirpQ9D8T7 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
SlirpQ9D8T7 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
SlirpQ9D8T7 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SlirpQ9D8T7 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SlirpQ9D8T7 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SlirpQ9D8T7 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SlirpQ9D8T7 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SlirpQ9D8T7 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SlirpQ9D8T7 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SlirpQ9D8T7 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
SlirpQ9D8T7 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
SlirpQ9D8T7 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SlirpQ9D8T7 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SlirpQ9D8T7 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SlirpQ9D8T7 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SlirpQ9D8T7 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SlirpQ9D8T7 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SlirpQ9D8T7 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SlirpQ9D8T7 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SlirpQ9D8T7 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SlirpQ9D8T7 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SlirpQ9D8T7 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SlirpQ9D8T7 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SlirpQ9D8T7 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SlirpQ9D8T7 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SlirpQ9D8T7 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SlirpQ9D8T7 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SlirpQ9D8T7 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SlirpQ9D8T7 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SlirpQ9D8T7 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SlirpQ9D8T7 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SlirpQ9D8T7 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SlirpQ9D8T7 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SlirpQ9D8T7 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SlirpQ9D8T7 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
SlirpQ9D8T7 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SlirpQ9D8T7 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SlirpQ9D8T7 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SlirpQ9D8T7 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SlirpQ9D8T7 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SlirpQ9D8T7 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
SlirpQ9D8T7 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SlirpQ9D8T7 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SlirpQ9D8T7 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SlirpQ9D8T7 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SlirpQ9D8T7 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SlirpQ9D8T7 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SlirpQ9D8T7 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.3 ms