Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8C3

Alg13, Putative bifunctional UDP-N-acetylglucosamine transferase and deubiquitinase ALG13, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,166 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alg13Q9D8C3 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Alg13Q9D8C3 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Alg13Q9D8C3 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Alg13Q9D8C3 Slc10a1-203ENSMUST00000218342 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Alg13Q9D8C3 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Alg13Q9D8C3 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Alg13Q9D8C3 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Alg13Q9D8C3 CT009489.1-201ENSMUST00000227740 1893 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Alg13Q9D8C3 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Alg13Q9D8C3 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Alg13Q9D8C3 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Alg13Q9D8C3 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Alg13Q9D8C3 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Alg13Q9D8C3 Tmem62-202ENSMUST00000110686 2417 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Alg13Q9D8C3 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Alg13Q9D8C3 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Alg13Q9D8C3 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Alg13Q9D8C3 Gm9519-201ENSMUST00000206108 1337 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Alg13Q9D8C3 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Alg13Q9D8C3 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Alg13Q9D8C3 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Alg13Q9D8C3 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Alg13Q9D8C3 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Alg13Q9D8C3 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Alg13Q9D8C3 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Alg13Q9D8C3 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Alg13Q9D8C3 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Alg13Q9D8C3 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Alg13Q9D8C3 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Alg13Q9D8C3 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Alg13Q9D8C3 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Alg13Q9D8C3 Rbm3-205ENSMUST00000115619 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Alg13Q9D8C3 Gm13047-201ENSMUST00000117116 815 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Alg13Q9D8C3 Gm14219-201ENSMUST00000120414 288 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Alg13Q9D8C3 Rpl19-ps1-201ENSMUST00000121059 591 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Alg13Q9D8C3 Gm14154-201ENSMUST00000142642 579 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Alg13Q9D8C3 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Alg13Q9D8C3 4930405O22Rik-201ENSMUST00000164605 954 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Alg13Q9D8C3 4930535L15Rik-201ENSMUST00000175891 536 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Alg13Q9D8C3 Cfap73-201ENSMUST00000177908 921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Alg13Q9D8C3 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Alg13Q9D8C3 Gm37406-201ENSMUST00000192478 500 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Alg13Q9D8C3 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Alg13Q9D8C3 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Alg13Q9D8C3 Mrpl23-206ENSMUST00000210662 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
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